45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1652 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  100 
 
 
474 aa  988    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  55.37 
 
 
471 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  54.21 
 
 
458 aa  489  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  50.32 
 
 
465 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  48.94 
 
 
476 aa  456  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  48.15 
 
 
535 aa  421  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  46.17 
 
 
533 aa  416  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  43.96 
 
 
507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  43.87 
 
 
477 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  41.88 
 
 
544 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  42.56 
 
 
477 aa  387  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  42.34 
 
 
483 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  40.34 
 
 
474 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  38.87 
 
 
471 aa  349  6e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  39.37 
 
 
478 aa  341  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  37.82 
 
 
467 aa  322  8e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  35.71 
 
 
473 aa  300  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  35.36 
 
 
485 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  33.25 
 
 
497 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  33.1 
 
 
520 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  31.92 
 
 
498 aa  213  7e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  32.95 
 
 
520 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  33.1 
 
 
520 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  33.1 
 
 
520 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  32.95 
 
 
520 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  32.32 
 
 
482 aa  207  5e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  31.42 
 
 
529 aa  169  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  25 
 
 
552 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  25.51 
 
 
639 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  25.84 
 
 
549 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  25.25 
 
 
750 aa  89.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  26.08 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  25.71 
 
 
548 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  24.28 
 
 
605 aa  76.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  22.39 
 
 
562 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  23.48 
 
 
561 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  22.99 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  22.46 
 
 
593 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  25.61 
 
 
549 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  32.91 
 
 
509 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  22.2 
 
 
586 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  34.07 
 
 
630 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  24.59 
 
 
437 aa  50.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61870  hypothetical protein  25.54 
 
 
412 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  26.26 
 
 
412 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>