41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1689 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  100 
 
 
478 aa  1006    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  53.25 
 
 
474 aa  544  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  47.6 
 
 
471 aa  463  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  46.32 
 
 
483 aa  441  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  45 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  43.24 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  41.46 
 
 
467 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  38.53 
 
 
473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  39.37 
 
 
474 aa  341  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  37.34 
 
 
476 aa  341  2e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  36.58 
 
 
471 aa  320  5e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  40.05 
 
 
458 aa  310  4e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  36.51 
 
 
544 aa  306  6e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  33.97 
 
 
465 aa  299  9e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  37.03 
 
 
533 aa  297  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  37.2 
 
 
535 aa  291  1e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  32.46 
 
 
507 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  34.76 
 
 
520 aa  243  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  34.51 
 
 
520 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  34.51 
 
 
520 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  34.51 
 
 
520 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  34.51 
 
 
520 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  35.07 
 
 
498 aa  237  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  35.19 
 
 
485 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  35.95 
 
 
497 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  28.85 
 
 
482 aa  169  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  27.86 
 
 
529 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  23.99 
 
 
639 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  22.84 
 
 
562 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  24.83 
 
 
586 aa  95.5  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  24 
 
 
549 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  24.21 
 
 
548 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  23.79 
 
 
548 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  23.64 
 
 
562 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  24.22 
 
 
605 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  22.44 
 
 
549 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  23.3 
 
 
750 aa  80.5  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  23.33 
 
 
593 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  20.73 
 
 
552 aa  76.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  23.74 
 
 
561 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  26.32 
 
 
509 aa  56.6  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>