24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_61870  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  832    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  93.69 
 
 
412 aa  783    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  43.6 
 
 
437 aa  274  3e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0142  peptidase U34, dipeptidase  47.83 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0527  peptidase U34, dipeptidase  36.17 
 
 
415 aa  242  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0269  peptidase U34 dipeptidase  42.46 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0390  peptidase U34, dipeptidase  42.62 
 
 
396 aa  215  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17087  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0494  dipeptidase-like protein  50 
 
 
166 aa  127  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000183252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  31.22 
 
 
548 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  30.73 
 
 
548 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  30.88 
 
 
549 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  30.69 
 
 
593 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  26.2 
 
 
482 aa  60.5  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  29.89 
 
 
552 aa  57.4  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  32.73 
 
 
509 aa  56.2  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  25 
 
 
639 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  27.36 
 
 
605 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  25.54 
 
 
474 aa  47.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  24.05 
 
 
529 aa  47  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  26.36 
 
 
465 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  25.6 
 
 
477 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  26.37 
 
 
467 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  29.17 
 
 
630 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  27.87 
 
 
535 aa  44.3  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>