45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1068 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  100 
 
 		 467 aa  978    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  52.15 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  44.17 
 
 		 477 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  44.7 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  41.95 
 
 		 477 aa  391  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  41.46 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  42.86 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  42.71 
 
 		 474 aa  372  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  37.82 
 
 		 474 aa  322  8e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  38.73 
 
 		 476 aa  312  7.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  37.2 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  37 
 
 		 533 aa  287  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  38.17 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  35.61 
 
 		 544 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  34.18 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  35.36 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  35.36 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  35.15 
 
 		 520 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  38.14 
 
 		 520 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  35.15 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  37.44 
 
 		 471 aa  262  6.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  33.49 
 
 		 507 aa  249  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  33.12 
 
 		 485 aa  246  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  34.8 
 
 		 497 aa  232  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  33.66 
 
 		 498 aa  224  4e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  31.82 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  30.52 
 
 		 482 aa  210  4e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  27.03 
 
 		 639 aa  143  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  25.55 
 
 		 552 aa  128  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  24.25 
 
 		 548 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  24.25 
 
 		 549 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  25.24 
 
 		 605 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  24.05 
 
 		 548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  22.66 
 
 		 593 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  25.99 
 
 		 549 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  25.31 
 
 		 561 aa  93.6  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  27.32 
 
 		 562 aa  93.6  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  24.57 
 
 		 562 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  24.3 
 
 		 586 aa  90.1  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  23.5 
 
 		 750 aa  87.8  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  22.75 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  26.17 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  29.82 
 
 		 630 aa  47.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  26.92 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61870  hypothetical protein  26.37 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>