47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3966 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  98.72 
 
 
548 aa  1116    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  100 
 
 
548 aa  1126    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  73.32 
 
 
593 aa  782    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  97.45 
 
 
549 aa  1083    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  50.84 
 
 
552 aa  537  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  40.54 
 
 
586 aa  360  4e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  33.33 
 
 
639 aa  282  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  34.43 
 
 
605 aa  272  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  32.77 
 
 
562 aa  249  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  32.07 
 
 
562 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  28.84 
 
 
549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  27.85 
 
 
561 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  24.65 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  26.33 
 
 
498 aa  124  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  25.82 
 
 
477 aa  123  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  25.15 
 
 
477 aa  121  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  24.14 
 
 
520 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  24.14 
 
 
520 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  24.75 
 
 
520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  24.14 
 
 
520 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  24.14 
 
 
520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  26.17 
 
 
497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  24.05 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  25.87 
 
 
473 aa  114  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  24.6 
 
 
483 aa  110  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  30.18 
 
 
509 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  23.52 
 
 
507 aa  97.1  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  24.9 
 
 
485 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  23.19 
 
 
535 aa  95.5  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  23.14 
 
 
471 aa  94.4  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  23.79 
 
 
478 aa  93.6  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  25.29 
 
 
482 aa  92.8  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  24.76 
 
 
465 aa  91.7  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  25.71 
 
 
474 aa  89  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  23.17 
 
 
529 aa  89  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  23.8 
 
 
476 aa  89  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  21.69 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  25.63 
 
 
544 aa  82  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  23.87 
 
 
533 aa  79.7  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  21.96 
 
 
750 aa  69.3  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61870  hypothetical protein  30.73 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  27.99 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  23.11 
 
 
471 aa  66.6  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  24.01 
 
 
630 aa  66.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  28.89 
 
 
437 aa  60.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0527  peptidase U34, dipeptidase  29.71 
 
 
415 aa  52.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0390  peptidase U34, dipeptidase  32.86 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>