47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3888 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  98.36 
 
 
548 aa  1084    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  98.54 
 
 
548 aa  1084    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  73.7 
 
 
593 aa  789    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  100 
 
 
549 aa  1130    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  51.41 
 
 
552 aa  543  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  40.9 
 
 
586 aa  365  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  32.98 
 
 
639 aa  286  7e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  34.61 
 
 
605 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  33.33 
 
 
562 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  32.07 
 
 
562 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  29.41 
 
 
549 aa  220  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  28.02 
 
 
561 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  24.85 
 
 
474 aa  130  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  26.43 
 
 
498 aa  125  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  26.01 
 
 
477 aa  125  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  25.35 
 
 
477 aa  124  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  24.33 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  24.33 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  24.33 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  24.95 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  24.33 
 
 
520 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  24.25 
 
 
467 aa  117  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  25.78 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  26.17 
 
 
497 aa  115  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  24.8 
 
 
483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  31.14 
 
 
509 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  23.62 
 
 
535 aa  98.6  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  23.73 
 
 
507 aa  99.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  23.54 
 
 
471 aa  98.6  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  25.1 
 
 
485 aa  97.4  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  24 
 
 
478 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  25.29 
 
 
482 aa  93.6  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  24.76 
 
 
465 aa  91.7  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  25.84 
 
 
474 aa  91.3  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  23.87 
 
 
476 aa  90.5  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  23.17 
 
 
529 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  21.91 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  25.86 
 
 
544 aa  84  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  22.53 
 
 
533 aa  83.2  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  22.37 
 
 
750 aa  68.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  23.33 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61870  hypothetical protein  30.88 
 
 
412 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  24.69 
 
 
630 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  30.88 
 
 
412 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  29.44 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0527  peptidase U34, dipeptidase  29.71 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0390  peptidase U34, dipeptidase  33.57 
 
 
396 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>