147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6841 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  100 
 
 		 84 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 84 aa  92  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  62.5 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  53.57 
 
 		 85 aa  83.6  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  53.01 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  57.5 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  53.57 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  53.01 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000452156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0456  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  39.53 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  38.89 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  35.29 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  32.18 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  37.93 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  35.63 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  34.09 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  35.63 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  32.94 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  35.63 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  33.72 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  36.78 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  33.72 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  33.72 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  33.72 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  36.9 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  34.48 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  38.04 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  32.95 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  35.42 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  34.48 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  34.48 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3181  30S ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0928109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  33.72 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 98 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 90 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  34.48 
 
 		 92 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  35.16 
 
 		 88 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 98 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>