More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2957 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 372 aa  769    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  56.52 
 
 		 384 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  56.87 
 
 		 380 aa  421  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  39.56 
 
 		 370 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  36.46 
 
 		 374 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  35.8 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  34.92 
 
 		 424 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  33.51 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  35.07 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  35.26 
 
 		 399 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 400 aa  219  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  35.53 
 
 		 402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  34.76 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  32.08 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  34.05 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  34.69 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  32.78 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  32.52 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  34.68 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  34.68 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  32.61 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.62 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 		 415 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  32.6 
 
 		 402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  33.78 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  31.45 
 
 		 415 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 		 396 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  32.05 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.6 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  31.08 
 
 		 393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  32.97 
 
 		 393 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  33.24 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  30.68 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  30.16 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  30.11 
 
 		 411 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  28.69 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  29.08 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  29.13 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  29.2 
 
 		 467 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  26.74 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  28.32 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  30.16 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  27.57 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  27.19 
 
 		 496 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  27.98 
 
 		 392 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  30.52 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  26.59 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  27.98 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  27.6 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  27.37 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  26.58 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  29.14 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  29.02 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  27.22 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  26.61 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  25.08 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  22.1 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  26.44 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  24.92 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  24.61 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.53 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.22 
 
 		 371 aa  92.8  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  27.37 
 
 		 469 aa  91.3  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  25.82 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.39 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  24.65 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  24.52 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  24.52 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  24.04 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  25.07 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  24.8 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  26.37 
 
 		 438 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  22.94 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  23.82 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  25.66 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  25.16 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  25.55 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  25.75 
 
 		 408 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  24.11 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  26.37 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  23.55 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  21.34 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  22.97 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  23.26 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  22.97 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  23.94 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  23.88 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  22.19 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  23.99 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  22.6 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  23.68 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11206  FAD-dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02380)  22.99 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0213132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  20.37 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  23.17 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  24.55 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  21.43 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>