More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2939 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  100 
 
 		 312 aa  621  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  65.52 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  60.59 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  59.06 
 
 		 293 aa  350  2e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  55.33 
 
 		 312 aa  328  6e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.96 
 
 		 376 aa  272  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  47.64 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  46.05 
 
 		 369 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  47.39 
 
 		 395 aa  255  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  47.2 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  43.08 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  44.9 
 
 		 398 aa  252  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  44.74 
 
 		 369 aa  252  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  45.7 
 
 		 402 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.08 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  45.42 
 
 		 394 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  48.16 
 
 		 416 aa  249  5e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  45.1 
 
 		 322 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  45.1 
 
 		 322 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.1 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.1 
 
 		 321 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.1 
 
 		 321 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  45.1 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  44.7 
 
 		 356 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  45.1 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  44.63 
 
 		 473 aa  248  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  45.42 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.67 
 
 		 314 aa  248  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  48.53 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.45 
 
 		 314 aa  247  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  45.55 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  43.14 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  45.07 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  46.44 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  45.54 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.39 
 
 		 328 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  47.55 
 
 		 304 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  44.37 
 
 		 429 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  42.9 
 
 		 381 aa  242  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.64 
 
 		 359 aa  242  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  41.97 
 
 		 456 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  43.65 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  43.65 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.24 
 
 		 392 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.24 
 
 		 392 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.24 
 
 		 392 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  46.35 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2759  band 7 protein  43.85 
 
 		 406 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84305  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  43.52 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  44.37 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  47.06 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  43.86 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  44.82 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  43.3 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2414  band 7 protein  44.52 
 
 		 446 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.6 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.6 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  41.03 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  41.37 
 
 		 406 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  43.64 
 
 		 345 aa  232  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  44.36 
 
 		 312 aa  231  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  41.95 
 
 		 326 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  41.58 
 
 		 309 aa  228  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  44.81 
 
 		 361 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  42.53 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  39.27 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  46.29 
 
 		 311 aa  222  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  41.24 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  40.13 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  40.79 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  41.12 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  40.79 
 
 		 305 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  40.79 
 
 		 305 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  40.79 
 
 		 305 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  40.79 
 
 		 305 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  40.37 
 
 		 356 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.97 
 
 		 312 aa  215  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  40.79 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  40.79 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  40.79 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.79 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.79 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  40.79 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  40.79 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  40.79 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  40.92 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.46 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  41.46 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.84 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  41.75 
 
 		 333 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  38.26 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.05 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  38.05 
 
 		 310 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.49 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  38.68 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  40.8 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  38.72 
 
 		 326 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.1 
 
 		 316 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.08 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  47.08 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>