More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2603 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2603  glutamate 5-kinase  100 
 
 
282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1766  gamma-glutamyl kinase  53.51 
 
 
277 aa  278  9e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000141606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2583  gamma-glutamyl kinase  51.85 
 
 
269 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2904  gamma-glutamyl kinase  51.85 
 
 
269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2877  gamma-glutamyl kinase  52.04 
 
 
272 aa  268  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.518001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1645  glutamate 5-kinase  52.78 
 
 
266 aa  255  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  51 
 
 
372 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  50.97 
 
 
369 aa  249  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  50.98 
 
 
367 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  46.72 
 
 
378 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  48.18 
 
 
369 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  48.18 
 
 
369 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  50.58 
 
 
373 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  49.6 
 
 
370 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  48.29 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  45.95 
 
 
373 aa  235  8e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  50.79 
 
 
374 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  45.17 
 
 
373 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  52.16 
 
 
369 aa  229  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  50.39 
 
 
376 aa  227  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  47.66 
 
 
373 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  46.33 
 
 
260 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1717  gamma-glutamyl kinase  44.87 
 
 
270 aa  226  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 
367 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  48.05 
 
 
372 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  45.14 
 
 
373 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  45.59 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0283  gamma-glutamyl kinase  44.03 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  45.56 
 
 
390 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  46.55 
 
 
387 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  47.08 
 
 
366 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  43.46 
 
 
372 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  45.56 
 
 
376 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 
373 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  45.35 
 
 
376 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  44.62 
 
 
375 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  45.04 
 
 
367 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29301  Glutamate 5-kinase (Gamma-glutamyl kinase) (GK)  48.26 
 
 
447 aa  213  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  42.49 
 
 
383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  45.88 
 
 
373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  45.1 
 
 
377 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1676  gamma-glutamyl kinase  44.91 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  43.57 
 
 
406 aa  212  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  45.6 
 
 
260 aa  212  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  44.66 
 
 
371 aa  211  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  45.1 
 
 
373 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0346  glutamate 5-kinase  44.44 
 
 
262 aa  211  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  42.96 
 
 
379 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  42.18 
 
 
372 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  42.76 
 
 
372 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  45.69 
 
 
374 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  46.48 
 
 
372 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  43.46 
 
 
372 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  42.4 
 
 
372 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3448  gamma-glutamyl kinase  45.26 
 
 
371 aa  208  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0431842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  45.91 
 
 
372 aa  208  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0457  gamma-glutamyl kinase  46.81 
 
 
369 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  43.3 
 
 
374 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  44.71 
 
 
373 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  43.46 
 
 
372 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  41.31 
 
 
382 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  43.46 
 
 
372 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
374 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_12867  predicted protein  46.33 
 
 
413 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.047621  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  43.46 
 
 
372 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  43.19 
 
 
363 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  43.46 
 
 
372 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  43.46 
 
 
372 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1591  glutamate 5-kinase  42.2 
 
 
373 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107077  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  45.59 
 
 
374 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  44.27 
 
 
393 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  42.7 
 
 
374 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 
372 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  44.19 
 
 
372 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  45.14 
 
 
372 aa  205  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  43.46 
 
 
372 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  43.43 
 
 
381 aa  205  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
378 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  43.11 
 
 
394 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  43.63 
 
 
369 aa  205  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  44.53 
 
 
368 aa  205  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  43.11 
 
 
372 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  43.11 
 
 
372 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  43.11 
 
 
372 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  43.11 
 
 
372 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  43.02 
 
 
372 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  43.03 
 
 
376 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  45.14 
 
 
374 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  43.11 
 
 
372 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  43.11 
 
 
372 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  45.67 
 
 
379 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  43.3 
 
 
376 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  45.35 
 
 
372 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  43.3 
 
 
376 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
378 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  45.59 
 
 
385 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  43.23 
 
 
388 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  44.19 
 
 
372 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  45.14 
 
 
373 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  44.79 
 
 
367 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>