More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2904 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2904  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
269 aa  540  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2583  gamma-glutamyl kinase  99.63 
 
 
269 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1766  gamma-glutamyl kinase  67.16 
 
 
277 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000141606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2877  gamma-glutamyl kinase  64.93 
 
 
272 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.518001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1645  glutamate 5-kinase  58.53 
 
 
266 aa  298  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  53.88 
 
 
372 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2603  glutamate 5-kinase  51.85 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  50.38 
 
 
378 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0283  gamma-glutamyl kinase  47.57 
 
 
267 aa  266  4e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0346  glutamate 5-kinase  50.2 
 
 
262 aa  261  6e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1676  gamma-glutamyl kinase  49.05 
 
 
267 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  48.5 
 
 
373 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1717  gamma-glutamyl kinase  49.43 
 
 
270 aa  259  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  49.62 
 
 
374 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
375 aa  255  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  50.78 
 
 
373 aa  250  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  47.76 
 
 
373 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  47.37 
 
 
373 aa  235  6e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  44.85 
 
 
387 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  46.48 
 
 
373 aa  230  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
390 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  49.41 
 
 
373 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  46.48 
 
 
373 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  47.17 
 
 
373 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0947  glutamate 5-kinase  44.06 
 
 
268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0230243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  44.07 
 
 
406 aa  225  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  44.92 
 
 
373 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  46.06 
 
 
370 aa  222  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  48.44 
 
 
369 aa  222  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0294  glutamate 5-kinase  43.63 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  45.25 
 
 
373 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  44.75 
 
 
369 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  44.75 
 
 
369 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  41.83 
 
 
374 aa  218  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  43.4 
 
 
376 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  45.74 
 
 
367 aa  216  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  45.14 
 
 
367 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  41.06 
 
 
376 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  40.75 
 
 
382 aa  215  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2415  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
375 aa  214  9e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0941339  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  42.37 
 
 
260 aa  214  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.24 
 
 
383 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  45.21 
 
 
369 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  44.88 
 
 
374 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  43.07 
 
 
372 aa  211  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  42.37 
 
 
372 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  43.23 
 
 
372 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
372 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  43.19 
 
 
363 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  41.54 
 
 
260 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  41.04 
 
 
392 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
379 aa  208  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  45.56 
 
 
369 aa  208  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  42.01 
 
 
382 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  43.63 
 
 
381 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
394 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  44.27 
 
 
367 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  42.26 
 
 
383 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  41.7 
 
 
366 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  42.26 
 
 
383 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  42.69 
 
 
367 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  42.69 
 
 
367 aa  205  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  42.11 
 
 
377 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  42.48 
 
 
372 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  42.48 
 
 
372 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  46 
 
 
373 aa  204  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  42.41 
 
 
372 aa  204  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  41.89 
 
 
379 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  46 
 
 
373 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  42.91 
 
 
372 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  42.97 
 
 
367 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  42.41 
 
 
372 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  41.63 
 
 
374 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
372 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  42.54 
 
 
372 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  45.74 
 
 
393 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  41.44 
 
 
376 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  41.44 
 
 
376 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  42.29 
 
 
367 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  42.29 
 
 
386 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  42.29 
 
 
367 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  42.37 
 
 
378 aa  201  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  42.29 
 
 
414 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  41.31 
 
 
377 aa  201  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  42.29 
 
 
386 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  41.6 
 
 
378 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  43.02 
 
 
374 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  44.09 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>