More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29301 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_29301  Glutamate 5-kinase (Gamma-glutamyl kinase) (GK)  100 
 
 		 447 aa  922    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05817  glutamate 5-kinase (Eurofung)  55.45 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00530  glutamate 5-kinase, putative  54.73 
 
 		 511 aa  346  4e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.272789  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 369 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 369 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  42.89 
 
 		 376 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  42.82 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  40.45 
 
 		 367 aa  288  9e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  43.78 
 
 		 373 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  40.15 
 
 		 369 aa  283  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  39.61 
 
 		 370 aa  259  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  36.48 
 
 		 377 aa  259  8e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18224  predicted protein  39.38 
 
 		 403 aa  249  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  36.34 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  37.13 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  38.54 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  38.15 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  36.63 
 
 		 373 aa  239  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  37.66 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  37.47 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  38.15 
 
 		 367 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  38.15 
 
 		 367 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  38.15 
 
 		 367 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  38.15 
 
 		 367 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  38.15 
 
 		 367 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  37.97 
 
 		 367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  37.97 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  37.97 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  37.97 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  37.97 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  37.97 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  37.97 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  37.97 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  37.97 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  37.97 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  35.5 
 
 		 374 aa  232  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  37.19 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  36.54 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  40.58 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  36.54 
 
 		 373 aa  230  4e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  35.78 
 
 		 369 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_12867  predicted protein  40 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.047621  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  36.5 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  34.98 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  37.41 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  36.88 
 
 		 372 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  33.82 
 
 		 376 aa  222  9e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  35.22 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  35.31 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  36.75 
 
 		 372 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  37.53 
 
 		 373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  37.62 
 
 		 367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  35.16 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  37.62 
 
 		 367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  37.62 
 
 		 367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  37.28 
 
 		 367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  35.14 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  38.31 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  36.57 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  36.23 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  34.76 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  37.53 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  34.08 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  34.57 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  34.99 
 
 		 388 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  37.13 
 
 		 367 aa  216  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  37.38 
 
 		 367 aa  216  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  35.73 
 
 		 363 aa  216  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  36.54 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  35.56 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  35.21 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  35.66 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  35.04 
 
 		 371 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  35.8 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  38.46 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  36.19 
 
 		 369 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  33.42 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  35.31 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  35.47 
 
 		 376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2603  glutamate 5-kinase  48.26 
 
 		 282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  34.58 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  33.25 
 
 		 373 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  36.34 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  34.15 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  37.91 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  37.91 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  34.9 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  34.55 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  35.07 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  33.67 
 
 		 376 aa  211  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  35.07 
 
 		 372 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  36.17 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  35.16 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  35.16 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  36.14 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  36.14 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>