More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2290 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  60.3 
 
 		 231 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  56.16 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  58.45 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  58.45 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  55.67 
 
 		 236 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  58.79 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  53.27 
 
 		 265 aa  218  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  53.27 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  53.27 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  53.27 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  53.27 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  53.27 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  53.27 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  53.27 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  53.27 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  53.27 
 
 		 237 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  58.21 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  55.78 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  53.4 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  51.26 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  54.68 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  51.85 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  52.31 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  54.73 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  47.24 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  47.24 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  47.32 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 239 aa  178  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  49.5 
 
 		 241 aa  177  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  46.31 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  46.57 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  47.5 
 
 		 239 aa  175  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  47.03 
 
 		 243 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  45.77 
 
 		 241 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  46.08 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  44.83 
 
 		 242 aa  171  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  45.23 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  45.77 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  46.23 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  47.32 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  46.8 
 
 		 246 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  44.06 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  45.05 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  44.5 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  41.58 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  55.93 
 
 		 149 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  59.09 
 
 		 114 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  58.89 
 
 		 118 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  54.74 
 
 		 126 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  48.67 
 
 		 113 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  51.33 
 
 		 118 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  34.02 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  30.92 
 
 		 257 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  30.92 
 
 		 257 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  30.65 
 
 		 250 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  28.97 
 
 		 245 aa  94  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  29.88 
 
 		 234 aa  91.7  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  32.1 
 
 		 249 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1496  sigma 28 (flagella/sporulation)  29.37 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2066  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  32.03 
 
 		 259 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000506599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  29.76 
 
 		 260 aa  89.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  30.24 
 
 		 252 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0064  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  31.5 
 
 		 285 aa  89.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.534501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  28.11 
 
 		 257 aa  89  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0577  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  32.51 
 
 		 280 aa  89.4  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4361  RNA polymerase sigma-K factor  50.59 
 
 		 100 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0114  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  29.79 
 
 		 344 aa  88.2  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  28.92 
 
 		 256 aa  88.2  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  29.03 
 
 		 259 aa  87.8  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1702  RpoS  30.12 
 
 		 303 aa  87.8  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0629652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3903  sporulation sigma factor SigF  30 
 
 		 252 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.715722  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1436  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  27.27 
 
 		 344 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  29.72 
 
 		 256 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0478  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  31.51 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  28.92 
 
 		 272 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  29.03 
 
 		 292 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1204  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.73 
 
 		 327 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000153411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  28.51 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  29.03 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4142  sporulation sigma factor SigF  31.56 
 
 		 252 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000821538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  29.03 
 
 		 289 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3983  sporulation sigma factor SigF  31.56 
 
 		 252 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00304797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  27.71 
 
 		 255 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4294  sporulation sigma factor SigF  31.56 
 
 		 252 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.728684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  29.03 
 
 		 259 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  29.03 
 
 		 259 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4182  sporulation sigma factor SigF  31.56 
 
 		 252 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0460854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  29.03 
 
 		 259 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1056  sporulation sigma factor SigF  31.56 
 
 		 252 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.656155  normal  0.0661655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>