More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2008 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 585 aa  1194    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  31.51 
 
 		 577 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  31.84 
 
 		 569 aa  290  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  28.81 
 
 		 597 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  29.83 
 
 		 595 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  29.95 
 
 		 567 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  41.47 
 
 		 488 aa  240  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  38.28 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  35.71 
 
 		 603 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 580 aa  216  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  27.3 
 
 		 589 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  32.6 
 
 		 604 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  29.09 
 
 		 603 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  29.61 
 
 		 604 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  25.91 
 
 		 587 aa  189  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  27.15 
 
 		 597 aa  187  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  28.57 
 
 		 594 aa  183  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  28.06 
 
 		 633 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  23.36 
 
 		 627 aa  174  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  29.17 
 
 		 599 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 576 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  31.43 
 
 		 594 aa  170  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  29.82 
 
 		 600 aa  170  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  39.34 
 
 		 506 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  26.03 
 
 		 610 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  33.45 
 
 		 583 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  32.44 
 
 		 564 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  28.23 
 
 		 600 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  28.97 
 
 		 612 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  33.09 
 
 		 583 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  23.29 
 
 		 617 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  29.85 
 
 		 596 aa  156  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  26.81 
 
 		 574 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  24.19 
 
 		 623 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 640 aa  151  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  27.75 
 
 		 578 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  29.74 
 
 		 600 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  34.21 
 
 		 414 aa  148  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  32.28 
 
 		 578 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  33.83 
 
 		 574 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  34.33 
 
 		 426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  37.81 
 
 		 455 aa  140  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  36.1 
 
 		 576 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  34.58 
 
 		 403 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 502 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  33.57 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  36.32 
 
 		 450 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0617  signal transduction histidine kinase, LytS  30.51 
 
 		 601 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  28.34 
 
 		 498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  33.85 
 
 		 586 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  31.35 
 
 		 495 aa  134  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  34.3 
 
 		 607 aa  134  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  34.33 
 
 		 465 aa  134  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 483 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  33.96 
 
 		 578 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  32.37 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  34.15 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  34.48 
 
 		 400 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  34.98 
 
 		 394 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 		 568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  30.19 
 
 		 573 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2372  histidine kinase internal region  28.33 
 
 		 595 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  34.58 
 
 		 410 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  32.19 
 
 		 391 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  34.11 
 
 		 410 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  31.37 
 
 		 572 aa  126  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  29.63 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  31.16 
 
 		 408 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  32.52 
 
 		 405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  32.06 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  31.86 
 
 		 394 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 408 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  32.42 
 
 		 564 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  31.78 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  30.04 
 
 		 428 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  30.04 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  33.01 
 
 		 440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  32.08 
 
 		 428 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  30.6 
 
 		 580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  30.13 
 
 		 568 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  32.86 
 
 		 432 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  28.67 
 
 		 581 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  31.47 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  29.61 
 
 		 374 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  32.66 
 
 		 431 aa  117  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  31.03 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  27.03 
 
 		 603 aa  115  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 		 403 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 		 403 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  32.11 
 
 		 409 aa  115  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 		 403 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  30.81 
 
 		 394 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  32.51 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  32.87 
 
 		 433 aa  114  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  34.3 
 
 		 645 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  32.57 
 
 		 402 aa  113  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  28.77 
 
 		 397 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  31.9 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>