More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3857 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 581 aa  1198    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  32 
 
 		 627 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  32.43 
 
 		 623 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  28.53 
 
 		 600 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 580 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 502 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  30.31 
 
 		 583 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  23.21 
 
 		 567 aa  137  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  30.29 
 
 		 597 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  30.53 
 
 		 569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 583 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  28.34 
 
 		 603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  29.1 
 
 		 488 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  33.2 
 
 		 600 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  27.55 
 
 		 578 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  28.16 
 
 		 578 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  27.3 
 
 		 595 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  30.1 
 
 		 574 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  29.41 
 
 		 587 aa  118  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 585 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  30.64 
 
 		 594 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  28.42 
 
 		 577 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  29.57 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  30.71 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  27.46 
 
 		 599 aa  114  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  33.8 
 
 		 607 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  34.33 
 
 		 389 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  32.24 
 
 		 414 aa  110  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  26.88 
 
 		 564 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  28.63 
 
 		 604 aa  108  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  29.83 
 
 		 600 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  29.96 
 
 		 576 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  25.2 
 
 		 495 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  26.09 
 
 		 604 aa  105  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  31.19 
 
 		 594 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  34.18 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  30.17 
 
 		 403 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  28.85 
 
 		 574 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 433 aa  104  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  28.28 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  22.67 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 640 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 576 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.24 
 
 		 578 aa  102  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  32.99 
 
 		 568 aa  101  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  34.3 
 
 		 586 aa  100  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 335 aa  97.8  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 394 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  31.86 
 
 		 377 aa  97.8  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  30.14 
 
 		 589 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  30.14 
 
 		 589 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  30.14 
 
 		 589 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 566 aa  96.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  30.14 
 
 		 589 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  30.14 
 
 		 589 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  30.43 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  25.19 
 
 		 597 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  30.14 
 
 		 589 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 589 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0617  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 601 aa  95.9  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  30.14 
 
 		 589 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 450 aa  94.4  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  29.17 
 
 		 568 aa  94.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  29.67 
 
 		 589 aa  94  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  35.48 
 
 		 410 aa  94  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  32.21 
 
 		 565 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  32.21 
 
 		 565 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  32.21 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  28.85 
 
 		 610 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  28.99 
 
 		 591 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  32.21 
 
 		 565 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  34.45 
 
 		 410 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 400 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 357 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  32.69 
 
 		 565 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  30.67 
 
 		 367 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 392 aa  91.3  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  32.24 
 
 		 398 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 405 aa  91.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  31.73 
 
 		 559 aa  91.3  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  31.75 
 
 		 374 aa  91.3  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  29.9 
 
 		 340 aa  91.3  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 446 aa  90.9  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  31.25 
 
 		 576 aa  90.5  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  31.73 
 
 		 446 aa  90.9  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  30.67 
 
 		 455 aa  90.1  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 574 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 581 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  29.57 
 
 		 393 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  27.31 
 
 		 596 aa  89.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  27.15 
 
 		 612 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  33.62 
 
 		 564 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  27.83 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.6 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>