More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1336 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  100 
 
 		 817 aa  1694    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  35.71 
 
 		 783 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  35.71 
 
 		 783 aa  459  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  33.18 
 
 		 835 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  33.53 
 
 		 839 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  33.37 
 
 		 835 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  32.28 
 
 		 847 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  31.95 
 
 		 848 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  41.28 
 
 		 886 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  31.57 
 
 		 836 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  30.85 
 
 		 872 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  31.91 
 
 		 862 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  31.56 
 
 		 810 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  33.97 
 
 		 783 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  30.09 
 
 		 838 aa  350  8e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  30.27 
 
 		 837 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  29.75 
 
 		 852 aa  343  5.999999999999999e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  29.48 
 
 		 835 aa  335  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  28.44 
 
 		 828 aa  330  8e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  31.79 
 
 		 767 aa  326  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  29.4 
 
 		 877 aa  320  7.999999999999999e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  29.41 
 
 		 847 aa  319  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  29.91 
 
 		 716 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  32.66 
 
 		 723 aa  315  2.9999999999999996e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  29.13 
 
 		 823 aa  308  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  27.92 
 
 		 840 aa  305  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  29.45 
 
 		 833 aa  303  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  28.69 
 
 		 826 aa  301  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  28.95 
 
 		 825 aa  301  4e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  35.04 
 
 		 783 aa  301  4e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  32.03 
 
 		 790 aa  300  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  29.15 
 
 		 722 aa  298  3e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  36.23 
 
 		 873 aa  295  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  28.61 
 
 		 790 aa  290  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  28.68 
 
 		 818 aa  286  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  26.44 
 
 		 826 aa  284  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  35.98 
 
 		 839 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  27.92 
 
 		 841 aa  283  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  29.93 
 
 		 790 aa  280  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  28.84 
 
 		 792 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  29.54 
 
 		 790 aa  277  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  28.98 
 
 		 792 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  30.2 
 
 		 736 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  29.26 
 
 		 835 aa  273  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  27.96 
 
 		 832 aa  273  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  28.74 
 
 		 878 aa  266  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  34.5 
 
 		 621 aa  265  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  35.53 
 
 		 834 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  34.51 
 
 		 805 aa  262  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  28.28 
 
 		 822 aa  261  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  34.45 
 
 		 622 aa  258  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  26.12 
 
 		 851 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  39.51 
 
 		 746 aa  247  6.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  25.52 
 
 		 843 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  42.91 
 
 		 411 aa  244  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  42.65 
 
 		 419 aa  243  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  40.52 
 
 		 404 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  43.92 
 
 		 406 aa  233  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  33.57 
 
 		 696 aa  231  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  41.76 
 
 		 404 aa  231  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  39.24 
 
 		 406 aa  231  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  32.1 
 
 		 667 aa  230  9e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  26.42 
 
 		 876 aa  230  9e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  37.74 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  41.58 
 
 		 408 aa  229  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  41.28 
 
 		 430 aa  229  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  35.57 
 
 		 427 aa  229  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  31.6 
 
 		 638 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  42.86 
 
 		 403 aa  228  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  38.39 
 
 		 409 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  30.97 
 
 		 653 aa  227  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  30.86 
 
 		 652 aa  226  9e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  29.98 
 
 		 649 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  38.08 
 
 		 409 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  30.6 
 
 		 667 aa  225  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  30.6 
 
 		 653 aa  225  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  30.6 
 
 		 653 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  30.6 
 
 		 653 aa  225  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  30.6 
 
 		 667 aa  225  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  28.7 
 
 		 640 aa  225  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  30.6 
 
 		 667 aa  225  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  30.6 
 
 		 667 aa  225  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  31.58 
 
 		 641 aa  224  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  37.99 
 
 		 420 aa  224  6e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  41.61 
 
 		 407 aa  224  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  36.7 
 
 		 548 aa  223  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  41.13 
 
 		 404 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  31 
 
 		 637 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  31.14 
 
 		 655 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  40.15 
 
 		 428 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  38.87 
 
 		 405 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  30.65 
 
 		 654 aa  221  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  30.34 
 
 		 654 aa  220  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  31.04 
 
 		 638 aa  220  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  30.65 
 
 		 654 aa  220  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  30.65 
 
 		 654 aa  220  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  30.65 
 
 		 654 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  30.63 
 
 		 654 aa  220  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  31.05 
 
 		 638 aa  219  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  30.49 
 
 		 666 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>