More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0553 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 591 aa  698    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 627 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 594 aa  704    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 597 aa  643    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 588 aa  651    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 590 aa  708    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 591 aa  699    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 591 aa  697    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 591 aa  696    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 591 aa  696    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 591 aa  697    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 590 aa  697    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 602 aa  657    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 588 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 593 aa  697    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 596 aa  699    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 589 aa  707    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 592 aa  710    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 588 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 594 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 606 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 		 593 aa  701    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 591 aa  697    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 593 aa  713    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 		 600 aa  701    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 608 aa  738    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 		 594 aa  723    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 592 aa  763    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 591 aa  696    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 		 601 aa  663    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 600 aa  637    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 		 593 aa  824    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 585 aa  653    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 		 594 aa  795    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 597 aa  756    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 597 aa  756    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 598 aa  1224    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 597 aa  665    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 586 aa  660    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 595 aa  800    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 613 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 591 aa  698    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 598 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 594 aa  711    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 600 aa  761    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 610 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 591 aa  692    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 598 aa  689    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 587 aa  632  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 582 aa  630  1e-179  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 589 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 587 aa  630  1e-179  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 599 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 594 aa  625  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 619 aa  625  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 617 aa  627  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 599 aa  626  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 588 aa  625  1e-178  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 589 aa  624  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 597 aa  618  1e-176  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 598 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 582 aa  620  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 583 aa  621  1e-176  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 589 aa  621  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 599 aa  616  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 598 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 598 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 597 aa  616  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 596 aa  617  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 607 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 614 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4606  aspartyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 589 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 595 aa  614  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 600 aa  614  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 594 aa  611  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 592 aa  611  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 617 aa  610  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4178  aspartyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 589 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 592 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 602 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 602 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 593 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 583 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 598 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 596 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 596 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0111  aspartyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 616 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2160  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 601 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1248  aspartyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 583 aa  603  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 596 aa  601  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 602 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 600 aa  599  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 591 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 591 aa  599  1e-170  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 597 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>