39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0475 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0475  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 469 aa  964    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000269672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1383  tetratricopeptide TPR_2  26.42 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1448  tetratricopeptide TPR_2  24.19 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  27.32 
 
 		 334 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2380  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 246 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 750 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.7 
 
 		 738 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.53 
 
 		 462 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 265 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 265 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.17 
 
 		 810 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1421 aa  46.6  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 804 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 4079 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1662  hypothetical protein  23.56 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  26.62 
 
 		 306 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 499 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 542 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  24.08 
 
 		 340 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 878 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 565 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 649 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  35 
 
 		 279 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1792  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 634 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 597 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 3145 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  29.37 
 
 		 706 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 471 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 		 605 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1112 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>