More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0418 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
422 aa  840    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  71.33 
 
 
422 aa  614  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  70.14 
 
 
422 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  68.72 
 
 
422 aa  594  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  67.54 
 
 
422 aa  591  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  67.54 
 
 
422 aa  580  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0385  protein of unknown function DUF214  72.27 
 
 
422 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0295868  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0609  protein of unknown function DUF214  34.94 
 
 
422 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000928533  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
424 aa  230  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1781  lipoprotein releasing system  32.61 
 
 
424 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0490622  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0551  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000638831  normal  0.237108 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0590  hypothetical protein  32.13 
 
 
424 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1599  lipoprotein releasing system  30.33 
 
 
422 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.526116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  30.14 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  30.14 
 
 
416 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  30.25 
 
 
416 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1839  protein of unknown function DUF214  29.09 
 
 
416 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  0.633197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  27.97 
 
 
419 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0832  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 
417 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  28.33 
 
 
416 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  28.33 
 
 
416 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.19 
 
 
416 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.22 
 
 
420 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.29 
 
 
416 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  27.91 
 
 
405 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 
423 aa  133  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.17 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  27.15 
 
 
409 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  27.18 
 
 
405 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.55 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  24.94 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.61 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  25.42 
 
 
408 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  24.58 
 
 
414 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.68 
 
 
410 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  21.46 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2993  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 
375 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.03 
 
 
414 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.51 
 
 
421 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.99 
 
 
417 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6489  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 
406 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  25.33 
 
 
448 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.99 
 
 
417 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  25.99 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  25.99 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  27.67 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  25.99 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  25.99 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  26.21 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  27.68 
 
 
417 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0384  lipoprotein releasing system transmembrane protein  25 
 
 
413 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.53 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0348  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.77 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.66 
 
 
414 aa  113  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  24.67 
 
 
417 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.67 
 
 
417 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.79 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.11 
 
 
417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  25.35 
 
 
389 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 
401 aa  111  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  26.3 
 
 
414 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.3 
 
 
414 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  23.49 
 
 
435 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.43 
 
 
417 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.1 
 
 
416 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.45 
 
 
417 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  23.82 
 
 
385 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.18 
 
 
417 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.89 
 
 
408 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.18 
 
 
417 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.43 
 
 
417 aa  106  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.18 
 
 
417 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.23 
 
 
417 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.66 
 
 
413 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 
404 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.17 
 
 
415 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.89 
 
 
414 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3477  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.6 
 
 
422 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.56 
 
 
416 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1609  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.11 
 
 
414 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146346  normal  0.0646675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.44 
 
 
427 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  25.94 
 
 
408 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.37 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1033  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.5 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.56 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.18 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0832  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 
383 aa  99  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2836  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.04 
 
 
415 aa  99  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620052  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.7 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.77 
 
 
439 aa  99  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.57 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 
408 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.89 
 
 
415 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  26.46 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.1 
 
 
414 aa  98.2  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299394  normal  0.273871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1920  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 
470 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.911684  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1041  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.78 
 
 
427 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0901467  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0813  hypothetical protein  24.6 
 
 
390 aa  97.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.4 
 
 
417 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.21 
 
 
439 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.123078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>