More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0115 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  54.62 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  55.38 
 
 		 260 aa  277  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  50.58 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  44.14 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  47.67 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  46.15 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  37.5 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  27.78 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  28.22 
 
 		 228 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  27.8 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  27.04 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0084  putative biotin synthesis protein  25.99 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  26.98 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  26 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  24.91 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  30.57 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  26.04 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  26.04 
 
 		 292 aa  72  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  27.46 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  24.62 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  24.62 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  24.62 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  24.62 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  25.64 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  24.62 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  32.92 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  30.32 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  25.18 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  35.96 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  23.77 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  28.51 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  24.91 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  35.22 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  24.72 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  33.33 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  24.54 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  29.45 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  24.91 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  31.65 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  26.18 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2062  putative methyl transferase  26.09 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00567331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2277  Methyltransferase type 12  23.92 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  32.1 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  32.08 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  28.48 
 
 		 474 aa  62.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  25.48 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  32.08 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  24.71 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  20.86 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  31.08 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  29.75 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  32.69 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  31.53 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  22.4 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  27.85 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.44 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  34 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  25.23 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  32.14 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  24.14 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  22.87 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  22.87 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  28.66 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  31.68 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  25 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  26.35 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  31.9 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  24.45 
 
 		 315 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  26.14 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  31.36 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  30.51 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  31.36 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  31.36 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25.64 
 
 		 558 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  36.8 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.93 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  29.3 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  29.81 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  31.68 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  33.85 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  31.62 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  29.3 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.57 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>