More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0242 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
730 aa  1504  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  1.13999e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  79.04 
 
 
760 aa  1231  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  76.99 
 
 
752 aa  1181  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  73.71 
 
 
762 aa  1126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  65.74 
 
 
750 aa  975  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  67.01 
 
 
774 aa  985  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  75.24 
 
 
755 aa  1162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  41.06 
 
 
783 aa  498  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  37.61 
 
 
762 aa  465  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  41.05 
 
 
742 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  37.96 
 
 
743 aa  461  1e-128  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  38.33 
 
 
794 aa  455  1e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  40.59 
 
 
743 aa  452  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  40.21 
 
 
743 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  40.59 
 
 
743 aa  452  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  40.15 
 
 
787 aa  452  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  38.36 
 
 
841 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  37.84 
 
 
740 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  39.84 
 
 
857 aa  441  1e-122  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  36.52 
 
 
786 aa  440  1e-122  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  39.84 
 
 
857 aa  441  1e-122  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
801 aa  442  1e-122  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  39.81 
 
 
838 aa  441  1e-122  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  37.54 
 
 
759 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  39.38 
 
 
862 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  39.26 
 
 
870 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.63 
 
 
834 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  39.41 
 
 
857 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 
768 aa  439  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  39.35 
 
 
826 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  39.78 
 
 
858 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  37.87 
 
 
772 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  38.96 
 
 
821 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  38.29 
 
 
765 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  39.81 
 
 
787 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  39.81 
 
 
732 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  39.26 
 
 
844 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  39.26 
 
 
844 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  39.88 
 
 
728 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 
810 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  39.26 
 
 
844 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  39.26 
 
 
844 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  39.26 
 
 
888 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  39.26 
 
 
839 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  39.26 
 
 
839 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  38.54 
 
 
928 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  36.87 
 
 
767 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  37.18 
 
 
854 aa  416  1e-115  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  36.72 
 
 
785 aa  416  1e-115  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  39.01 
 
 
846 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  37.83 
 
 
850 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.7 
 
 
846 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 
846 aa  415  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  38.44 
 
 
907 aa  411  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  34.87 
 
 
773 aa  406  1e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  36.81 
 
 
776 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  38.4 
 
 
678 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  38.69 
 
 
686 aa  402  1e-110  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  35.06 
 
 
850 aa  401  1e-110  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  36.8 
 
 
698 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.83 
 
 
786 aa  393  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  35.75 
 
 
795 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  37.08 
 
 
675 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  34.8 
 
 
815 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.44 
 
 
648 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  34.6 
 
 
748 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.61 
 
 
806 aa  356  8e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  35.62 
 
 
761 aa  355  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.28 
 
 
646 aa  354  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.46416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  34.75 
 
 
773 aa  354  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.78 
 
 
648 aa  352  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  34.48 
 
 
797 aa  351  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  34.5 
 
 
667 aa  350  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.45418e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 
793 aa  350  6e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  33.38 
 
 
835 aa  347  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  32.19 
 
 
833 aa  344  3e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.87 
 
 
765 aa  344  3e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  34.45 
 
 
796 aa  343  8e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  33.43 
 
 
777 aa  343  9e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  33.67 
 
 
802 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.13 
 
 
751 aa  342  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  34.54 
 
 
824 aa  341  3e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  35.28 
 
 
710 aa  341  3e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  32.83 
 
 
808 aa  340  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  35.07 
 
 
713 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  35.07 
 
 
713 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  35.07 
 
 
713 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 
709 aa  340  6e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  36.12 
 
 
709 aa  340  6e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 
709 aa  340  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  32.98 
 
 
804 aa  340  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  31.66 
 
 
807 aa  339  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  34.39 
 
 
794 aa  339  9e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  34.39 
 
 
779 aa  339  1e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  35.02 
 
 
713 aa  338  2e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  30.6 
 
 
807 aa  338  2e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  2.91309e-05 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  34.3 
 
 
707 aa  338  2e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  35.02 
 
 
713 aa  338  2e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  35.51 
 
 
714 aa  338  2e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  35.02 
 
 
713 aa  338  2e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>