60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_a028 on replicon NC_012040
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  100 
 
 		 1459 aa  2953    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  32.77 
 
 		 730 aa  155  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  32.77 
 
 		 730 aa  155  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  32.77 
 
 		 730 aa  155  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  36.02 
 
 		 730 aa  153  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  36.02 
 
 		 730 aa  152  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  31.16 
 
 		 724 aa  142  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  30.58 
 
 		 1976 aa  130  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  30.58 
 
 		 2795 aa  129  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  30.89 
 
 		 1417 aa  128  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  30.89 
 
 		 1418 aa  127  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  30.91 
 
 		 1417 aa  128  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  30.89 
 
 		 1396 aa  127  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  30.37 
 
 		 1417 aa  126  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  27.76 
 
 		 1746 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  32.8 
 
 		 2367 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  32.8 
 
 		 2383 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  32.8 
 
 		 2358 aa  115  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  26.67 
 
 		 2933 aa  115  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  31.8 
 
 		 410 aa  115  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  32.8 
 
 		 2620 aa  115  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  32.8 
 
 		 2296 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  26.44 
 
 		 1050 aa  113  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  26.38 
 
 		 1075 aa  112  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  32.26 
 
 		 2358 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  26.38 
 
 		 1075 aa  112  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  30.63 
 
 		 969 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  30.07 
 
 		 941 aa  109  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  32.68 
 
 		 292 aa  108  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  32.68 
 
 		 295 aa  108  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  26.63 
 
 		 1084 aa  108  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  24.65 
 
 		 5337 aa  105  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  24.65 
 
 		 4953 aa  105  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  26.26 
 
 		 2933 aa  101  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  29.54 
 
 		 934 aa  95.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  24.01 
 
 		 468 aa  90.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  26.37 
 
 		 497 aa  90.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  32.26 
 
 		 543 aa  79.7  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  28.79 
 
 		 660 aa  79.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  28.28 
 
 		 660 aa  78.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  28.79 
 
 		 660 aa  78.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  28.79 
 
 		 660 aa  78.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  28.79 
 
 		 660 aa  78.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  24.34 
 
 		 474 aa  70.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  24.34 
 
 		 474 aa  70.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  24.34 
 
 		 474 aa  70.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  25.67 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  21.26 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  21.26 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  21.26 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  21.26 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  21.26 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  21.26 
 
 		 464 aa  67.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  26.18 
 
 		 509 aa  66.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  20.96 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  22.67 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  22.67 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  31.86 
 
 		 302 aa  61.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  29.91 
 
 		 372 aa  49.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  31.82 
 
 		 690 aa  48.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>