106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1775 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 
369 aa  692    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  68.03 
 
 
381 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  69.04 
 
 
394 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  53.31 
 
 
387 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  46.22 
 
 
382 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.61 
 
 
378 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  45.95 
 
 
382 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  45.95 
 
 
382 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  44.26 
 
 
381 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  43.56 
 
 
377 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  47.09 
 
 
391 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  0.00000562153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  47.25 
 
 
377 aa  246  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  46.81 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  46.69 
 
 
362 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  44.9 
 
 
389 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  46.45 
 
 
383 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  45.95 
 
 
380 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.09 
 
 
381 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  43.39 
 
 
390 aa  235  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000187789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  46.22 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  47.51 
 
 
376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.41 
 
 
419 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000232035  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.76 
 
 
368 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  42.54 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  39.39 
 
 
387 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000592794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.89 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.24 
 
 
372 aa  212  7e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  41.92 
 
 
372 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  39.95 
 
 
435 aa  160  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.48 
 
 
281 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  29.32 
 
 
264 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  24.23 
 
 
266 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000060174  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.4 
 
 
284 aa  86.3  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.67 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.26 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.37 
 
 
284 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.09 
 
 
291 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.49 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.79 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.78 
 
 
281 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  26.87 
 
 
276 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.33 
 
 
281 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  27.68 
 
 
515 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.36 
 
 
261 aa  60.5  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.72 
 
 
502 aa  59.7  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2393  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.57 
 
 
277 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.64 
 
 
513 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.09 
 
 
510 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1214  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.09 
 
 
281 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.07 
 
 
579 aa  57.4  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.3 
 
 
505 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  28.88 
 
 
513 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  24.54 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  30.9 
 
 
513 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.55 
 
 
511 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.72 
 
 
511 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0231  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
330 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 
263 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.1 
 
 
503 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.73 
 
 
519 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.51 
 
 
509 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.31 
 
 
503 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  25.41 
 
 
250 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.63 
 
 
512 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  22.5 
 
 
266 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 
250 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  23.79 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3677  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.18 
 
 
255 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  35.63 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  35.63 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.38 
 
 
522 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  26.44 
 
 
250 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  33.71 
 
 
227 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  38.37 
 
 
219 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  38.75 
 
 
966 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  35.45 
 
 
235 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  24.1 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.79 
 
 
229 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.64 
 
 
508 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2012  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.71 
 
 
242 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  39.19 
 
 
601 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  42.47 
 
 
948 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  39.19 
 
 
601 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  34.12 
 
 
972 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.34 
 
 
511 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  39.19 
 
 
601 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  42.47 
 
 
948 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.39 
 
 
504 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.91 
 
 
226 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.8 
 
 
228 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  46.03 
 
 
973 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  46.03 
 
 
973 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3686  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.95 
 
 
217 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3765  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.65 
 
 
219 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.757734  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 
921 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0928  uroporphyrinogen-III synthase  29.89 
 
 
244 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2491  uroporphyrinogen-III synthase  31.91 
 
 
264 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  46.03 
 
 
502 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1543  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.53 
 
 
263 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741801  normal  0.874786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>