103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0301 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  87.6 
 
 
382 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  87.6 
 
 
382 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  100 
 
 
380 aa  748    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  87.86 
 
 
382 aa  658    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  93.95 
 
 
380 aa  678    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  72 
 
 
381 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  58.49 
 
 
377 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  57.6 
 
 
378 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  54.18 
 
 
391 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  0.00000562153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  52.08 
 
 
390 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000187789  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  53.93 
 
 
383 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  53.53 
 
 
376 aa  332  6e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  53.95 
 
 
362 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  54.95 
 
 
381 aa  328  9e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  53.21 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  52.59 
 
 
362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  51.21 
 
 
368 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  48.82 
 
 
389 aa  315  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  48.38 
 
 
391 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  42.9 
 
 
377 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  47.33 
 
 
372 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.03 
 
 
381 aa  262  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  47.81 
 
 
387 aa  260  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  43.99 
 
 
394 aa  256  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.22 
 
 
369 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40.43 
 
 
387 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40.76 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000592794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.94 
 
 
419 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000232035  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.04 
 
 
372 aa  222  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  41.76 
 
 
435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  33.72 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.02 
 
 
281 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  29.5 
 
 
266 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000060174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.48 
 
 
284 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.1 
 
 
261 aa  84  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.82 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.69 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.37 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.6 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.04 
 
 
511 aa  73.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  27.84 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.24 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.3 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.72 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.19 
 
 
281 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.31 
 
 
503 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.74 
 
 
503 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.47 
 
 
503 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  28.97 
 
 
513 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  26.87 
 
 
276 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2393  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.08 
 
 
277 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  28.63 
 
 
513 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.37 
 
 
507 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0493  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.19 
 
 
267 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.74 
 
 
491 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.57 
 
 
260 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.35 
 
 
513 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.6 
 
 
519 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  26.91 
 
 
266 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.51 
 
 
505 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.95 
 
 
579 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.86 
 
 
502 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 
226 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 
227 aa  46.6  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 
266 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1241  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  43.24 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0151467 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1214  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.67 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  36.9 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 
237 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1420  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 
234 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1663  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650844  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.35 
 
 
245 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 
242 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 
242 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 
242 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.63 
 
 
225 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  34.15 
 
 
1089 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  34.15 
 
 
1089 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  34.15 
 
 
1075 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  37.89 
 
 
244 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  37.89 
 
 
244 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 
241 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  32.93 
 
 
1080 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14691  two-component response regulator  41.56 
 
 
254 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.132919  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3144  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.08 
 
 
226 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.549897  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.09 
 
 
510 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.07 
 
 
546 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  32.93 
 
 
1075 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  32.93 
 
 
1063 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.27 
 
 
511 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1124  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.747385  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  32.93 
 
 
1075 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12191  two-component response regulator  40.26 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12201  two-component response regulator  40.26 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2404  two component transcriptional regulator  27.62 
 
 
255 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.88 
 
 
504 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0637  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 
254 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12041  two-component response regulator  38.96 
 
 
245 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.99 
 
 
226 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  28.92 
 
 
520 aa  43.1  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>