35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1214 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1214  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  43.97 
 
 
269 aa  203  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1461  uroporphyrinogen-III synthase (HemD)  32.92 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  25.98 
 
 
377 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.48 
 
 
381 aa  62.4  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.59 
 
 
387 aa  62.4  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.91 
 
 
390 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000187789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.59 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.3 
 
 
387 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000592794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.54 
 
 
391 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.93 
 
 
376 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.17 
 
 
378 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.49 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  27.49 
 
 
389 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.81 
 
 
382 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.19 
 
 
368 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.45 
 
 
382 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.45 
 
 
382 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0287  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.84 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.98 
 
 
383 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.57 
 
 
394 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1215  uroporphyrinogen-III synthase (HemD), conjectural  26.3 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.65 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.01 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.01 
 
 
380 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.28 
 
 
281 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.31 
 
 
508 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.81 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  23.9 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24 
 
 
569 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.09 
 
 
577 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24 
 
 
571 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.92 
 
 
435 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.67 
 
 
380 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  23.68 
 
 
277 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>