81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2282 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 419 aa  810    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000232035  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  53.91 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  51.92 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  52.22 
 
 		 387 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000592794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  50.69 
 
 		 387 aa  319  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.03 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  47.51 
 
 		 362 aa  279  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  46.96 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  46.3 
 
 		 389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  44.85 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  44.08 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  43.87 
 
 		 377 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.07 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.3 
 
 		 376 aa  262  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  43.99 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  45.3 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  43.62 
 
 		 390 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000187789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  44.2 
 
 		 383 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  44.75 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  0.00000562153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  42.74 
 
 		 382 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.78 
 
 		 378 aa  245  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  42.47 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  42.47 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  41.94 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  42.47 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  45.16 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.41 
 
 		 369 aa  233  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.55 
 
 		 368 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.46 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  38.92 
 
 		 435 aa  173  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  32.06 
 
 		 264 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.99 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  29.01 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000060174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.99 
 
 		 284 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.11 
 
 		 284 aa  90.9  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.5 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.33 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.48 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.49 
 
 		 269 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  28.92 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.2 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.19 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.87 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.94 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.86 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  28.98 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.96 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  26.91 
 
 		 276 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  29.72 
 
 		 513 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.7 
 
 		 511 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1214  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.42 
 
 		 281 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.37 
 
 		 503 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.57 
 
 		 513 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.58 
 
 		 519 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  33.72 
 
 		 224 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.28 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.29 
 
 		 546 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.17 
 
 		 511 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.74 
 
 		 503 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  23.89 
 
 		 266 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2393  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.87 
 
 		 277 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 226 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.73 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  25.64 
 
 		 266 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0286  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0293  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.973428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0298  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 225 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.77813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0397  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.53 
 
 		 505 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 224 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  35.4 
 
 		 219 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  41.89 
 
 		 591 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0294  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1057  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.78 
 
 		 505 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.8 
 
 		 231 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 658 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3765  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 219 aa  43.5  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.757734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8200  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.77 
 
 		 249 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  39.08 
 
 		 226 aa  43.5  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 1010 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2778  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>