86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1256 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  86.82 
 
 		 387 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000592794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  100 
 
 		 387 aa  771    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  65.01 
 
 		 377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  51.92 
 
 		 419 aa  349  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000232035  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  48.23 
 
 		 372 aa  341  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  45.28 
 
 		 387 aa  275  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  43.12 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  45.38 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.9 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000187789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.4 
 
 		 376 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.3 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  40 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  0.00000562153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  41.6 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40.05 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40.97 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40.21 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40.7 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40.7 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  41.67 
 
 		 362 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40.43 
 
 		 380 aa  242  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  41.94 
 
 		 362 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41 
 
 		 381 aa  238  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  39.89 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.16 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  40 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.84 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.86 
 
 		 368 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.51 
 
 		 391 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  39.02 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  36.73 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  31.06 
 
 		 266 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000060174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.2 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  31.13 
 
 		 264 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.82 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.5 
 
 		 291 aa  99.8  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.95 
 
 		 284 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.09 
 
 		 284 aa  88.6  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.44 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.98 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.48 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.69 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.19 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.24 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  24.91 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.87 
 
 		 519 aa  62.8  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.77 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  25.1 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.68 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3677  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28 
 
 		 255 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.72 
 
 		 502 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1057  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.59 
 
 		 505 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1106  uroporphyrinogen-III synthase  22.49 
 
 		 266 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000478387  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.54 
 
 		 511 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  26.12 
 
 		 513 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2012  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.09 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1028  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.36 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.82 
 
 		 497 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.24 
 
 		 503 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6380  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.47 
 
 		 223 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  34.83 
 
 		 251 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.01 
 
 		 507 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  46.6  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.27 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.84 
 
 		 503 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.91 
 
 		 226 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1676  two component transcriptional regulator  29.47 
 
 		 219 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  26.84 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 227 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1539  response regulator receiver protein  40 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.26981 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 658 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  32.14 
 
 		 223 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.17 
 
 		 579 aa  43.9  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  32.14 
 
 		 223 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.82 
 
 		 266 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1032  response regulator  31.71 
 
 		 232 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0894814  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.7 
 
 		 505 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  34.12 
 
 		 1010 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4083  two component transcriptional regulator  36.26 
 
 		 223 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1015  DNA-binding response regulator  28.95 
 
 		 256 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.58 
 
 		 491 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  24.8 
 
 		 228 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.74 
 
 		 229 aa  42.7  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>