47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0052 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.63 
 
 		 391 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  0.00000562153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.97 
 
 		 383 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.4 
 
 		 362 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.08 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.82 
 
 		 362 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.63 
 
 		 390 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000187789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  27.38 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.68 
 
 		 378 aa  95.5  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.27 
 
 		 368 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  29.57 
 
 		 389 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.13 
 
 		 381 aa  89  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.05 
 
 		 387 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.32 
 
 		 377 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.22 
 
 		 381 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.8 
 
 		 271 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  26.32 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000060174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.72 
 
 		 383 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  24.14 
 
 		 387 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000592794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.78 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  24.62 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.78 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.56 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.78 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.48 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.07 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.1 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.43 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.24 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.62 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.8 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.33 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000232035  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.48 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.71 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.19 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.49 
 
 		 491 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.89 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.9 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1214  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.59 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  23.27 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.74 
 
 		 369 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  27.27 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.6 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1106  uroporphyrinogen-III synthase  25.2 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000478387  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0493  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.7 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0928  uroporphyrinogen-III synthase  30.85 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.58 
 
 		 512 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>