More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09800 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 427 aa  855    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  79.16 
 
 		 426 aa  662    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  78.22 
 
 		 426 aa  691    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  58.33 
 
 		 426 aa  506  9.999999999999999e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  47.44 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  45.98 
 
 		 438 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  45.68 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  46.51 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  45.45 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  47.91 
 
 		 435 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  47.44 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  46.9 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  47.07 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  48.17 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  46.98 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  47.33 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  46.8 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  47.71 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  46.7 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  46.76 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  45.81 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  46.61 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  45.98 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  46.58 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  46.47 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  49.06 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  46 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  44.64 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  47.44 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  45.94 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  47.34 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  47.45 
 
 		 419 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  46.29 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  45.88 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.74 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  46.4 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  45.43 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  46.56 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  47.21 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  46.36 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  48.06 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  44.84 
 
 		 445 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  45.52 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  47.09 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  45.74 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  47.82 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  46.4 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  44.49 
 
 		 457 aa  363  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  46.98 
 
 		 423 aa  362  6e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  44.42 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  45.64 
 
 		 424 aa  359  5e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  45.45 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  47.37 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  45.26 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  45.56 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  44.86 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  43.24 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  44.69 
 
 		 448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  46.12 
 
 		 421 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  45.73 
 
 		 437 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  46.06 
 
 		 420 aa  352  8.999999999999999e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  45.56 
 
 		 443 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  44.55 
 
 		 446 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  45.56 
 
 		 443 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.89 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 		 446 aa  349  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.2 
 
 		 463 aa  349  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 		 446 aa  348  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  45.07 
 
 		 453 aa  348  8e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  45.69 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  44.21 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  43.46 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  42.09 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  45.05 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 		 446 aa  345  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  44.39 
 
 		 437 aa  345  8e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.89 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  44.63 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  42.82 
 
 		 444 aa  342  7e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 446 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 446 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 446 aa  342  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  43.33 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  43.84 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  44.47 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  46.43 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  44.68 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  43.56 
 
 		 437 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  44.68 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  44.68 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  43.28 
 
 		 430 aa  340  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  44.68 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  43.42 
 
 		 446 aa  338  8e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>