More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2560 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  50.65 
 
 		 709 aa  656    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 700 aa  1428    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  35.97 
 
 		 701 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 		 655 aa  331  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.25 
 
 		 761 aa  310  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 		 643 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  36.83 
 
 		 645 aa  303  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  36.69 
 
 		 647 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  38.2 
 
 		 646 aa  293  9e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.77 
 
 		 618 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  35.43 
 
 		 639 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  29.35 
 
 		 645 aa  280  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 671 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 		 642 aa  276  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 		 703 aa  275  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 		 648 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 		 802 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 		 802 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 809 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  34.55 
 
 		 803 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 		 802 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 		 802 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  33.92 
 
 		 626 aa  267  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.67 
 
 		 636 aa  267  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 634 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  33.08 
 
 		 673 aa  266  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.07 
 
 		 609 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  34.36 
 
 		 802 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 		 765 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 		 765 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  35.47 
 
 		 760 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  34.36 
 
 		 803 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  35.01 
 
 		 761 aa  262  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  32.82 
 
 		 630 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 		 767 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 		 764 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  34.1 
 
 		 771 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  34.69 
 
 		 756 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  35.04 
 
 		 646 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  33.93 
 
 		 646 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  33.78 
 
 		 775 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 650 aa  255  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.6 
 
 		 646 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  35.5 
 
 		 640 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  34.84 
 
 		 646 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  33.93 
 
 		 646 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  34.17 
 
 		 619 aa  253  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  32.63 
 
 		 629 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  33.21 
 
 		 800 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  32.63 
 
 		 629 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  33.07 
 
 		 631 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  32.63 
 
 		 629 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  33.15 
 
 		 625 aa  251  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  29.42 
 
 		 635 aa  250  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  33.07 
 
 		 631 aa  250  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  27.78 
 
 		 655 aa  249  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.63 
 
 		 629 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  29.31 
 
 		 667 aa  246  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 		 643 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  33.86 
 
 		 635 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  29.43 
 
 		 643 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  34.05 
 
 		 681 aa  244  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  27.94 
 
 		 646 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  32.76 
 
 		 801 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.47 
 
 		 646 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  33.65 
 
 		 611 aa  243  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  30.37 
 
 		 586 aa  243  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 		 631 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 		 630 aa  242  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  33.4 
 
 		 625 aa  240  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 		 603 aa  241  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 		 607 aa  239  9e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 630 aa  239  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.16 
 
 		 641 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  28.49 
 
 		 655 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  32.2 
 
 		 617 aa  238  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  27.75 
 
 		 633 aa  237  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  32.2 
 
 		 617 aa  237  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  28.77 
 
 		 631 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  28.29 
 
 		 630 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  27.75 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  27.75 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  27.75 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  27.75 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  28.77 
 
 		 667 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 		 689 aa  236  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  27.89 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.39 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  27.75 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  27.75 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  27.75 
 
 		 633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  35.4 
 
 		 641 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 		 793 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  32.21 
 
 		 801 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 		 766 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  31.64 
 
 		 679 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 		 630 aa  231  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.66 
 
 		 628 aa  231  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  32.02 
 
 		 801 aa  231  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>