More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1323 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
425 aa  861  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  68.24 
 
 
424 aa  568  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  58.82 
 
 
427 aa  469  1e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.27765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  57.24 
 
 
428 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  57.85 
 
 
432 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  54.23 
 
 
423 aa  435  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.29 
 
 
426 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.64035e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  55.61 
 
 
428 aa  428  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.01 
 
 
429 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  54.69 
 
 
427 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  54.8 
 
 
428 aa  425  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  54.8 
 
 
428 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  55.04 
 
 
428 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  54.67 
 
 
428 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  54.8 
 
 
428 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  54.67 
 
 
428 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  54.67 
 
 
428 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  54.67 
 
 
428 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  54.67 
 
 
428 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  55.58 
 
 
428 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  55.58 
 
 
428 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  54.82 
 
 
422 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.76 
 
 
426 aa  405  1e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.94 
 
 
425 aa  399  1e-110  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  53.23 
 
 
437 aa  399  1e-110  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  51.16 
 
 
430 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  51.16 
 
 
430 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  51.65 
 
 
419 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  52.89 
 
 
435 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.77 
 
 
417 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  48.95 
 
 
430 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  4.54316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  50.69 
 
 
437 aa  380  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  53.43 
 
 
424 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.65 
 
 
437 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  51.54 
 
 
423 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  46.87 
 
 
439 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.78 
 
 
452 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.37 
 
 
426 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.58 
 
 
438 aa  361  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.77499e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  51.75 
 
 
425 aa  355  9e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.24 
 
 
454 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.08 
 
 
482 aa  352  8e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.15993e-05  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  48.47 
 
 
439 aa  351  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.01 
 
 
439 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  47.55 
 
 
435 aa  349  6e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  46.17 
 
 
428 aa  349  7e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  47.55 
 
 
435 aa  348  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  54.27 
 
 
346 aa  345  9e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.33 
 
 
464 aa  340  4e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.47894e-05  hitchhiker  3.62877e-14 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  45.81 
 
 
436 aa  336  5e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.46 
 
 
435 aa  332  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  43.35 
 
 
500 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.74 
 
 
338 aa  329  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  53.35 
 
 
338 aa  325  8e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12232e-08  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.41 
 
 
432 aa  325  1e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  45.09 
 
 
434 aa  324  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.89 
 
 
463 aa  323  3e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.84 
 
 
428 aa  323  4e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  53.66 
 
 
338 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  43.96 
 
 
439 aa  322  6e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  53.45 
 
 
353 aa  321  2e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  45.56 
 
 
481 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.19 
 
 
491 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.68 
 
 
488 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  53.61 
 
 
387 aa  315  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.6 
 
 
338 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.73 
 
 
464 aa  315  1e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  1.09453e-12 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  44.01 
 
 
493 aa  315  1e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.06 
 
 
463 aa  314  2e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  44.29 
 
 
450 aa  314  2e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  43.32 
 
 
440 aa  313  3e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.73 
 
 
434 aa  313  3e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.15 
 
 
415 aa  313  4e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  9.3637e-06  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  42.63 
 
 
516 aa  312  8e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.47 
 
 
354 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  51.75 
 
 
343 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.47 
 
 
354 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  45.33 
 
 
481 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.03 
 
 
427 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.47 
 
 
354 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  52.55 
 
 
338 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  9.9426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.17 
 
 
338 aa  309  6e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.71 
 
 
458 aa  309  6e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  52.55 
 
 
338 aa  308  1e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  51.06 
 
 
329 aa  307  2e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  51.06 
 
 
329 aa  307  2e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.99 
 
 
505 aa  306  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  50.61 
 
 
353 aa  305  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.82 
 
 
336 aa  305  9e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  53.12 
 
 
337 aa  303  3e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  45.5 
 
 
454 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.84 
 
 
350 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  52.68 
 
 
348 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  51.37 
 
 
352 aa  300  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  42.15 
 
 
541 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  50.45 
 
 
397 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  50.94 
 
 
337 aa  296  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 
333 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  42.49 
 
 
519 aa  294  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  50.91 
 
 
327 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>