More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1250 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 574 aa  1165    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  24.36 
 
 		 597 aa  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  24.37 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  28.61 
 
 		 617 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  30.53 
 
 		 577 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  27.24 
 
 		 603 aa  134  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 640 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  31.05 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  27.06 
 
 		 600 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 576 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  33.12 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  26.68 
 
 		 623 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 580 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  32.3 
 
 		 567 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 585 aa  125  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 583 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 583 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  30.07 
 
 		 581 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  27.94 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  28.12 
 
 		 599 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  26.67 
 
 		 594 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  35.98 
 
 		 414 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  33.03 
 
 		 604 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  30.07 
 
 		 604 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 502 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  27.55 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.87 
 
 		 578 aa  115  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  28.03 
 
 		 597 aa  114  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  29.85 
 
 		 610 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  28.98 
 
 		 569 aa  113  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  31.68 
 
 		 568 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  26.32 
 
 		 394 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  26.22 
 
 		 603 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  30.15 
 
 		 595 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  29.84 
 
 		 612 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  31.03 
 
 		 428 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  31.56 
 
 		 600 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  23.81 
 
 		 589 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  26.05 
 
 		 391 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  30.14 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  31.16 
 
 		 576 aa  107  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 410 aa  107  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  29.51 
 
 		 600 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  34.36 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  32.31 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  31.75 
 
 		 403 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  28.12 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  28.12 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  28.12 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  27.72 
 
 		 335 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 410 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  27.18 
 
 		 498 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  28.37 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  28.12 
 
 		 557 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  30.26 
 
 		 338 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  36.61 
 
 		 408 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  26.24 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  25.84 
 
 		 564 aa  103  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  27.09 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  27.6 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  27.6 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  28.57 
 
 		 374 aa  101  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  30.23 
 
 		 576 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  27.35 
 
 		 411 aa  101  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 483 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  26.12 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  27.88 
 
 		 408 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  32.99 
 
 		 607 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  29.92 
 
 		 573 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  30.61 
 
 		 581 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  30.27 
 
 		 568 aa  99  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  26.6 
 
 		 394 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  27.88 
 
 		 408 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 566 aa  98.6  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  32.49 
 
 		 558 aa  97.8  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  28.57 
 
 		 596 aa  97.4  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  30.61 
 
 		 581 aa  97.4  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  28.25 
 
 		 465 aa  97.4  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  30.96 
 
 		 645 aa  97.4  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  30.41 
 
 		 575 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  26.12 
 
 		 559 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  26.12 
 
 		 559 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  30.05 
 
 		 432 aa  97.1  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  26.12 
 
 		 559 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  25.21 
 
 		 563 aa  97.1  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  26.12 
 
 		 559 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  26.12 
 
 		 559 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  26.35 
 
 		 574 aa  97.1  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  32.52 
 
 		 559 aa  97.1  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  26.12 
 
 		 565 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  26.12 
 
 		 565 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  31.09 
 
 		 393 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  26.12 
 
 		 559 aa  96.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  26.88 
 
 		 587 aa  96.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  30.1 
 
 		 405 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  26.12 
 
 		 565 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 561 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  26.29 
 
 		 374 aa  95.9  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 561 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>