73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4202 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  930    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 492 aa  362  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 474 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 466 aa  203  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 462 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 467 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 469 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  31.88 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  32.38 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 462 aa  187  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 466 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  31.2 
 
 		 435 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.84 
 
 		 443 aa  166  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 493 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  27.61 
 
 		 435 aa  148  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  27.61 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  27.77 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  25 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  24.31 
 
 		 424 aa  116  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 456 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 462 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 456 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  26.27 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 467 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 445 aa  87  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  22.27 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  25.65 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  22 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  20.88 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  23.44 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  21.74 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  19.91 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  22.88 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  21.53 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 414 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 444 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  25.11 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  24.66 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  25.91 
 
 		 408 aa  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 572 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  23.52 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  19.83 
 
 		 440 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  24.27 
 
 		 448 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  20.88 
 
 		 474 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  21.52 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  20.91 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>