More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0061 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  652    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  39.58 
 
 
306 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  39.22 
 
 
306 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  39.22 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  32.84 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  38.03 
 
 
338 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2455  hypothetical protein  32.86 
 
 
310 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4657  protein of unknown function DUF182  33.56 
 
 
309 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  33.11 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  29.65 
 
 
389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  31.91 
 
 
356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  33.22 
 
 
323 aa  116  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  35.14 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  30.41 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  29.81 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  31.6 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  30.03 
 
 
366 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  31.27 
 
 
365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  29.25 
 
 
376 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  30.65 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  33.77 
 
 
340 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0294  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.39 
 
 
318 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00242  hypothetical protein  31.39 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3336  hypothetical protein  31.39 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0329  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.72 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451243  normal  0.871321 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00245  hypothetical protein  31.39 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.936924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  30.32 
 
 
326 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  31.77 
 
 
323 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  29.97 
 
 
381 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.77 
 
 
368 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  31.77 
 
 
323 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  30.34 
 
 
390 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  26.45 
 
 
319 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  31.87 
 
 
372 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  33.64 
 
 
368 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3321  protein of unknown function DUF182  30.74 
 
 
318 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.51 
 
 
250 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  31.42 
 
 
323 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  30.77 
 
 
320 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  32.21 
 
 
322 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.48 
 
 
228 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  30.72 
 
 
322 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  30.74 
 
 
323 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  31.33 
 
 
357 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  30.58 
 
 
318 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  30.45 
 
 
385 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  42.14 
 
 
425 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  30.36 
 
 
323 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.91 
 
 
345 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  31.92 
 
 
327 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  31.87 
 
 
370 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  28.16 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  29.74 
 
 
386 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  30.52 
 
 
386 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.18 
 
 
234 aa  99.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  30.52 
 
 
386 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.08 
 
 
323 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  28.53 
 
 
374 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  31.08 
 
 
323 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  28.78 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  31.99 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  29.66 
 
 
373 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.75 
 
 
244 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  27.06 
 
 
398 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  28.7 
 
 
372 aa  96.7  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  25.77 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  32.35 
 
 
225 aa  96.3  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  41.1 
 
 
385 aa  95.9  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  34.32 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.12 
 
 
248 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  26.99 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  27.39 
 
 
329 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  26.67 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  40.4 
 
 
242 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  29.04 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  29.15 
 
 
340 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  38 
 
 
242 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  38 
 
 
242 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  35.12 
 
 
483 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.18 
 
 
228 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.6 
 
 
176 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  33.54 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.48 
 
 
233 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.13 
 
 
233 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  32.67 
 
 
331 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  36.54 
 
 
230 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  28.72 
 
 
338 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  28.82 
 
 
339 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.72 
 
 
341 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  30.5 
 
 
312 aa  89.4  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  29.05 
 
 
333 aa  89.4  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  30.5 
 
 
380 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  28.13 
 
 
369 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  31.1 
 
 
340 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  28.67 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  34.84 
 
 
233 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  28.4 
 
 
370 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.02 
 
 
230 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  26.44 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>