234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2455 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2455  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4657  protein of unknown function DUF182  58.33 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00242  hypothetical protein  54.24 
 
 		 318 aa  305  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00245  hypothetical protein  54.24 
 
 		 318 aa  305  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.936924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0329  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  53.9 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451243  normal  0.871321 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3336  hypothetical protein  53.9 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0294  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  53.56 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3321  protein of unknown function DUF182  53.22 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  34.75 
 
 		 316 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  31.83 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  34.67 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  32.86 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  34.32 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  31.02 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  32.9 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1701  hypothetical protein  36 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.177535  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  31.65 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  31.55 
 
 		 340 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  29.74 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  30.29 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  33.33 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  30.94 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.39 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  28.27 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  29.03 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  30.79 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  28.75 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  32.63 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.39 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  30.62 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  28.43 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  34.11 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  30.29 
 
 		 453 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  30.87 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  30.87 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  31.19 
 
 		 341 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  27.71 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  30.39 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  30.39 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  30.55 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  30.55 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  30.55 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  30.23 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  29.48 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  30.23 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  30.23 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  29.62 
 
 		 337 aa  99.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  29.45 
 
 		 363 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  28.29 
 
 		 374 aa  99.4  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  26.82 
 
 		 386 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  26.82 
 
 		 386 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  26.82 
 
 		 386 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  27.45 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  29.81 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  29.08 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  29.57 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  28.75 
 
 		 368 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  28.98 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  31.69 
 
 		 357 aa  93.2  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  29.24 
 
 		 385 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  28.21 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  25.92 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  29.27 
 
 		 327 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  28.93 
 
 		 329 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  28.74 
 
 		 368 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  28.47 
 
 		 334 aa  89  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  28.67 
 
 		 356 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  28.04 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  26.96 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  29.38 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  28.48 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  29.03 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  27.65 
 
 		 390 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  28.48 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  29.05 
 
 		 370 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.35 
 
 		 228 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  28.9 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  48.39 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  29.67 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  35.67 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  28.8 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  28.29 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  28.48 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  28.71 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  28.29 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  29.83 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  26.78 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.77 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  28.71 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  29.41 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  46.39 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  30.07 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  29.84 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  27.99 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.48 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  28.94 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  29.39 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  51.14 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.13 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>