229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1701 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1701  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.177535  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4657  protein of unknown function DUF182  40.6 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2455  hypothetical protein  36 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3336  hypothetical protein  33.67 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0294  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.67 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00242  hypothetical protein  33.67 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00245  hypothetical protein  33.67 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.936924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0329  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.33 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451243  normal  0.871321 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3321  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 		 318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  29.81 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  29.84 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  30.03 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.75 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.43 
 
 		 341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  31.73 
 
 		 325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  29.56 
 
 		 343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  29.56 
 
 		 343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  32.48 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.21 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  33.1 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  28.12 
 
 		 340 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  30 
 
 		 453 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  28.89 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  32 
 
 		 316 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  31.03 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  26.71 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  30.7 
 
 		 341 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  31.01 
 
 		 341 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  30.41 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  30.7 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  30.7 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  33.02 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  30.61 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  31.45 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  30.38 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  32.38 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  30.17 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  31.1 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  30.7 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  28.25 
 
 		 342 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  34.2 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  30.43 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  27.94 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  27.94 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  30.25 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  29.08 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  30.6 
 
 		 329 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  31.01 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  31.33 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  28.78 
 
 		 387 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  30.51 
 
 		 381 aa  93.6  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  28.68 
 
 		 334 aa  93.2  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  29.77 
 
 		 342 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  28.8 
 
 		 337 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  29.23 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  28.27 
 
 		 364 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  31.63 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  89.7  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  29.08 
 
 		 372 aa  89.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  28.08 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  32.87 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  28.52 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  28.86 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  28.89 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  28.66 
 
 		 373 aa  86.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  31.38 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  28.95 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  28.9 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  29.02 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  29.83 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  27.48 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  26.42 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  26.89 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  28.06 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  30.36 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  28.82 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  27.16 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  27.16 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  26.43 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  29.84 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  29.75 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  27.47 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  29.8 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  29.8 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  29.8 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  24.5 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  28.48 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  25.29 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  28.47 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  28.1 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  28.1 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  30.37 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  24.39 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  27.01 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  29.15 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2838  protein of unknown function DUF182  42.42 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>