More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1302 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  500  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.42 
 
 
272 aa  271  5e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.04 
 
 
272 aa  252  5e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
260 aa  174  2e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
244 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23251e-09 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
264 aa  152  6e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 
269 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
293 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 
264 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.132419  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
277 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
257 aa  141  1e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
303 aa  140  1e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
258 aa  141  1e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
273 aa  140  2e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  4.06118e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
338 aa  140  2e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 
269 aa  140  2e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
262 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
267 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  37.22 
 
 
269 aa  139  5e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
261 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
299 aa  138  8e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  42.25 
 
 
301 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
347 aa  135  6e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.11 
 
 
266 aa  134  2e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
254 aa  133  2e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 
275 aa  134  2e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
271 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
327 aa  132  4e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
266 aa  130  1e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  2.29698e-08 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3006  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 
258 aa  131  1e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.662258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
252 aa  131  1e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
332 aa  130  1e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
257 aa  130  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 
234 aa  130  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 
256 aa  130  2e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
305 aa  130  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 
256 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
317 aa  129  4e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
339 aa  129  5e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
268 aa  129  5e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  36.06 
 
 
275 aa  129  5e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 
336 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 
276 aa  128  8e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
280 aa  128  9e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
333 aa  127  1e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
267 aa  127  1e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  37.28 
 
 
258 aa  127  1e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  9.30327e-05 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
333 aa  127  1e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
258 aa  127  1e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  40.22 
 
 
847 aa  127  2e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
267 aa  127  2e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
273 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1140  short-chain dehydrogenase/reductase  35.64 
 
 
279 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
248 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
268 aa  126  4e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 
267 aa  126  4e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
267 aa  126  4e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
339 aa  126  4e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 
296 aa  126  4e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 
344 aa  126  4e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 
272 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
240 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
267 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
233 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  2.23483e-07  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
264 aa  125  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
254 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  38.22 
 
 
283 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 
269 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
314 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 
258 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
276 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
267 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  7.09968e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
273 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
262 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 
258 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 
258 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.18 
 
 
266 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 
272 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 
281 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
245 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
253 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
261 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
286 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 
271 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
250 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 
267 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.47 
 
 
264 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
273 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 
247 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
267 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
337 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  38.17 
 
 
283 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
262 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.47 
 
 
264 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
272 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
256 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.69 
 
 
264 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  36.7 
 
 
239 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
344 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
309 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>