149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0889 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1481  transporter, putative  73.62 
 
 		 441 aa  659    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0889  transporter, putative  100 
 
 		 437 aa  870    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1686  major facilitator superfamily MFS_1  77.16 
 
 		 454 aa  657    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000674894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1867  major facilitator transporter  74.83 
 
 		 436 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1094  major facilitator superfamily MFS_1  82.56 
 
 		 437 aa  706    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.929439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  64.69 
 
 		 438 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1578  major facilitator superfamily MFS_1  63.26 
 
 		 438 aa  543  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0877587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  34.19 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2269  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 427 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  23.82 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57608  predicted protein  25.68 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.371537 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01489  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04850)  23.52 
 
 		 533 aa  98.2  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0186505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 455 aa  53.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  21.71 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  36.17 
 
 		 471 aa  50.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 428 aa  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 384 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  24.02 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0368  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  24.59 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.16 
 
 		 390 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  24.59 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  29.93 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.16 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  22.85 
 
 		 476 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  24 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.43 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3434  General substrate transporter  25.7 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  24.56 
 
 		 455 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  24.59 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 453 aa  47.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  24.59 
 
 		 454 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4056  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713294  normal  0.178952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  21.87 
 
 		 390 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  34.57 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.33 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.33 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  37.33 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  37.33 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.33 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  21.16 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  25.99 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  20.87 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.33 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.33 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  25 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.33 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.33 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  30.4 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.87 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  21.87 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.14 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28.38 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>