More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7868 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 296 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  52.92 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  36.12 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  40.8 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  42.67 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  40.16 
 
 		 295 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  38.21 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.09 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  37.81 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  39.77 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 306 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  37.65 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  27.95 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  35.57 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2030  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02429  DNA-binding transcriptional activator of 3-phenylpropionic acid catabolism  32.79 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1131  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1140  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  32.79 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  30.61 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3769  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  32.79 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2822  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  32.79 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.922303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2689  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  32.79 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00584589  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02393  hypothetical protein  32.79 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  32.79 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>