43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7660 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 		 263 aa  524  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  37.5 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  33.96 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  37.21 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  36.36 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  40.45 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  40.8 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  38.55 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  27.54 
 
 		 187 aa  62  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  27.54 
 
 		 187 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  39.76 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  41.18 
 
 		 353 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  39.77 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  34.93 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  33.07 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  29.32 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  33.62 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  36.23 
 
 		 207 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  31.82 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  31.82 
 
 		 225 aa  52  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  35.92 
 
 		 412 aa  51.6  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  39.56 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  38.03 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  35.86 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  37.35 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  36.96 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  25 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  32.37 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  36.17 
 
 		 193 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  43.24 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  31.43 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  30.61 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  35.8 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  35.47 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  38.94 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  41.11 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  38.71 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  33.08 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  27.97 
 
 		 368 aa  47  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  35.42 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  25.62 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  39.47 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  34.41 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>