250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3671 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  100 
 
 
428 aa  864    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1966  amidohydrolase  36.34 
 
 
442 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  31.18 
 
 
493 aa  182  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6839  amidohydrolase  33.08 
 
 
437 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00614522  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  30.36 
 
 
443 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  30.02 
 
 
446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  28.37 
 
 
421 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.52 
 
 
413 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0275  amidohydrolase  30.71 
 
 
413 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362841 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  29.43 
 
 
423 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.92 
 
 
407 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  29.88 
 
 
428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.89 
 
 
438 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  29.19 
 
 
423 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  29.83 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0166  amidohydrolase  30.24 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  30.65 
 
 
426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  29.44 
 
 
445 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  29.06 
 
 
447 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  29.55 
 
 
432 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3412  amidohydrolase  30.61 
 
 
405 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.61 
 
 
407 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  28.46 
 
 
431 aa  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  26.27 
 
 
450 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  31.94 
 
 
421 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  28.91 
 
 
430 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  28.42 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  28.92 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  29.81 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  26.35 
 
 
412 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.92 
 
 
430 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  28.05 
 
 
440 aa  133  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.85 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  26.47 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.89 
 
 
426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  26.32 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  28.5 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  24.88 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  28.87 
 
 
419 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  28.57 
 
 
419 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  28.4 
 
 
414 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  27.49 
 
 
428 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.4 
 
 
433 aa  124  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  28.39 
 
 
444 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.76 
 
 
426 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  32 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  27.88 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  29.87 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  29.34 
 
 
402 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  25.18 
 
 
422 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  29.14 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.49 
 
 
407 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  27.36 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  27.51 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  29.05 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  29.31 
 
 
411 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  29.06 
 
 
409 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  25.31 
 
 
423 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  29.06 
 
 
409 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  29.43 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  29.06 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  27.86 
 
 
412 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  27.52 
 
 
416 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  30.12 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  29.26 
 
 
413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  28.61 
 
 
424 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  26.82 
 
 
433 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.42 
 
 
431 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  29.26 
 
 
413 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  27.79 
 
 
417 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 
445 aa  113  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.9 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  28.47 
 
 
486 aa  113  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  29.62 
 
 
417 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  29.62 
 
 
417 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  29.62 
 
 
417 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  27.4 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.36 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  26.04 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  28.24 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  28.21 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  27.65 
 
 
411 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  28.53 
 
 
408 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  28.53 
 
 
408 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  28.53 
 
 
408 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.43 
 
 
434 aa  110  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.85 
 
 
437 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  28.32 
 
 
413 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  25.97 
 
 
419 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  27.06 
 
 
443 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  25.13 
 
 
400 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  27.45 
 
 
391 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  28.43 
 
 
402 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  28.61 
 
 
429 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  26.2 
 
 
432 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  26.63 
 
 
413 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.11 
 
 
432 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  28.43 
 
 
404 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  27.99 
 
 
436 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  25.85 
 
 
411 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>