More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3479 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.77 
 
 
161 aa  151  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
158 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  53.15 
 
 
158 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.65 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.52 
 
 
160 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.62 
 
 
158 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  55.93 
 
 
155 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  47.62 
 
 
186 aa  134  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.18 
 
 
158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.07 
 
 
163 aa  131  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  43.97 
 
 
157 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.95 
 
 
164 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  42.28 
 
 
153 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  41.89 
 
 
154 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.33 
 
 
157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  50.4 
 
 
163 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.45 
 
 
150 aa  125  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  44.3 
 
 
156 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  47.92 
 
 
157 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.03 
 
 
163 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.95 
 
 
164 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.62 
 
 
159 aa  119  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  38.62 
 
 
159 aa  119  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.75 
 
 
155 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.46 
 
 
152 aa  118  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.86 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.41 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  45.64 
 
 
158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.28 
 
 
160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  43.17 
 
 
148 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.97 
 
 
159 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.46 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  45.31 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  43.51 
 
 
151 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  45.45 
 
 
161 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.4 
 
 
161 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  45.61 
 
 
147 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  45.61 
 
 
152 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
160 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  45.39 
 
 
157 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.52 
 
 
161 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.55 
 
 
155 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  53.27 
 
 
164 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  45.61 
 
 
149 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.89 
 
 
161 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  38.51 
 
 
155 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.75 
 
 
153 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.19 
 
 
190 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.54 
 
 
158 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.36 
 
 
153 aa  99  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.96 
 
 
188 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  54.64 
 
 
176 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.53 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.95 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.04 
 
 
153 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.67 
 
 
153 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.26 
 
 
163 aa  96.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  35.14 
 
 
167 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  34.57 
 
 
188 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.62 
 
 
157 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.86 
 
 
166 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.9 
 
 
159 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  40.62 
 
 
157 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.7 
 
 
166 aa  92.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.84 
 
 
158 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.67 
 
 
176 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
175 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.79 
 
 
146 aa  88.2  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.14 
 
 
301 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.87 
 
 
152 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.87 
 
 
162 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.67 
 
 
175 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.88 
 
 
147 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.5 
 
 
189 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.67 
 
 
175 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  37.12 
 
 
168 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.97 
 
 
361 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.97 
 
 
361 aa  86.3  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.67 
 
 
174 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.52 
 
 
152 aa  86.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.98 
 
 
164 aa  86.3  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.13 
 
 
165 aa  85.5  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  42.02 
 
 
171 aa  85.5  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.54 
 
 
179 aa  85.1  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  45.92 
 
 
148 aa  85.1  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.67 
 
 
174 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.46 
 
 
484 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.09 
 
 
177 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.76 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.86 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.14 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.35 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.82 
 
 
482 aa  82.4  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0911  cytidine and deoxycytidylate deaminase  51.85 
 
 
149 aa  82  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.312122  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  35.65 
 
 
154 aa  82  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  35.65 
 
 
154 aa  82  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.82 
 
 
166 aa  82  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  43.43 
 
 
148 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1496  tRNA-adenosine deaminase  34.01 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00298219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>