74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3288 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  611  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  62.3 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  62.3 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  64.97 
 
 		 297 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  56.83 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  51.46 
 
 		 324 aa  305  7e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  50.33 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  50.32 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  49.04 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  40.48 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  43.68 
 
 		 322 aa  218  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  29.93 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.36 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  40 
 
 		 568 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  29.74 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  41.03 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  27.36 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  27.87 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  34.78 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  32.81 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  28.11 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.8 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  26.61 
 
 		 546 aa  56.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  34.19 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.9 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.16 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  24.23 
 
 		 565 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  29.41 
 
 		 567 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  32.17 
 
 		 567 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  28.99 
 
 		 551 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.35 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  35.59 
 
 		 328 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.97 
 
 		 568 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  33.05 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  34.23 
 
 		 526 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.28 
 
 		 430 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  22.32 
 
 		 569 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  29.29 
 
 		 498 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  30.58 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.5 
 
 		 505 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  32.08 
 
 		 713 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  25.6 
 
 		 456 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  24.21 
 
 		 605 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.14 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  37.39 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  26.62 
 
 		 498 aa  46.2  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  34.21 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  28.33 
 
 		 542 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  26.19 
 
 		 456 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  31.97 
 
 		 570 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  28.37 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  32.43 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  27.41 
 
 		 464 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  33.33 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  33.33 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  32.79 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  25.69 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  20.68 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  28.29 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1195  hypothetical protein  27.88 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0219721  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  37.07 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  36.44 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  29.27 
 
 		 533 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  26.83 
 
 		 449 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  35.19 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  27.05 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  36.21 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  32.52 
 
 		 876 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  22.33 
 
 		 369 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  24.62 
 
 		 545 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  34.96 
 
 		 410 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  27.46 
 
 		 543 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  28.95 
 
 		 449 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>