More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3100 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 
493 aa  965  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  55.15 
 
 
476 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.26 
 
 
465 aa  446  1e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  53.28 
 
 
515 aa  441  1e-122  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  54.19 
 
 
489 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  54.93 
 
 
471 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  52.83 
 
 
494 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  50.41 
 
 
452 aa  416  1e-115  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  52.4 
 
 
505 aa  418  1e-115  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.26 
 
 
472 aa  418  1e-115  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.43 
 
 
509 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  53.75 
 
 
509 aa  406  1e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  53.62 
 
 
517 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  49.49 
 
 
484 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  53.31 
 
 
478 aa  400  1e-110  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  51.12 
 
 
551 aa  401  1e-110  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.51 
 
 
539 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  53.2 
 
 
480 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  50.89 
 
 
527 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39928e-14 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  49.9 
 
 
517 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  49.17 
 
 
457 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.69 
 
 
449 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  49.28 
 
 
455 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  52.23 
 
 
486 aa  378  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.28 
 
 
455 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.28 
 
 
455 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.54 
 
 
462 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.22 
 
 
508 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  50.21 
 
 
460 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  48.65 
 
 
543 aa  359  8e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.79 
 
 
440 aa  352  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  51.03 
 
 
460 aa  350  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  48.03 
 
 
502 aa  335  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.74 
 
 
495 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.03 
 
 
532 aa  328  9e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  46.6 
 
 
491 aa  313  4e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  27.86 
 
 
455 aa  202  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  30.3 
 
 
452 aa  202  1e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  27.99 
 
 
449 aa  202  1e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.58 
 
 
453 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  31.81 
 
 
457 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  32.93 
 
 
452 aa  193  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.2 
 
 
444 aa  190  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  31.5 
 
 
446 aa  189  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  31.57 
 
 
451 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  30.61 
 
 
448 aa  184  4e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.93735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  30.83 
 
 
452 aa  183  8e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  31.19 
 
 
452 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  30.99 
 
 
448 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  30.54 
 
 
440 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  28.89 
 
 
449 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  28.45 
 
 
462 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  29.45 
 
 
448 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  29.59 
 
 
448 aa  167  3e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  29.8 
 
 
442 aa  167  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  28.34 
 
 
456 aa  163  5e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  33.33 
 
 
439 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  27.98 
 
 
462 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  29.83 
 
 
431 aa  160  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.85655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  29.22 
 
 
440 aa  160  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.64 
 
 
424 aa  159  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  24.95 
 
 
442 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  25.35 
 
 
442 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  31.46 
 
 
464 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  30.07 
 
 
431 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  28.25 
 
 
444 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  23.27 
 
 
435 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  23.27 
 
 
435 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  23.05 
 
 
435 aa  152  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  26.02 
 
 
448 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  27.47 
 
 
444 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.12112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  26.02 
 
 
444 aa  150  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  30.08 
 
 
432 aa  149  1e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  28.57 
 
 
448 aa  148  2e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  26.68 
 
 
447 aa  148  2e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  27.29 
 
 
444 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  28.03 
 
 
438 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  34.74 
 
 
455 aa  147  4e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  34.74 
 
 
455 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  27.56 
 
 
449 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  26.07 
 
 
438 aa  146  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98868e-06 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  27.16 
 
 
443 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  26.12 
 
 
444 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  31.55 
 
 
451 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  28.32 
 
 
429 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  6.40703e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  28.32 
 
 
429 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  28.63 
 
 
451 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  34.79 
 
 
455 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  28.86 
 
 
445 aa  143  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  25.41 
 
 
444 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  31 
 
 
501 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  25.2 
 
 
444 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  25.3 
 
 
444 aa  143  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  25.2 
 
 
444 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  25.2 
 
 
444 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  25.2 
 
 
444 aa  143  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  28.42 
 
 
429 aa  142  1e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  25.35 
 
 
444 aa  142  1e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  26.81 
 
 
428 aa  142  1e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  27.72 
 
 
428 aa  142  1e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>