More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3189 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  100 
 
 		 491 aa  922    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  70.88 
 
 		 495 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.04 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  51.46 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  52.78 
 
 		 515 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  49.59 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  50.51 
 
 		 476 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  54.56 
 
 		 478 aa  353  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  52.13 
 
 		 460 aa  352  5.9999999999999994e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.91 
 
 		 455 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  51.69 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.69 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.25 
 
 		 509 aa  345  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.27 
 
 		 449 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.47 
 
 		 462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  50.91 
 
 		 471 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  51.69 
 
 		 457 aa  334  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  49.17 
 
 		 489 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  51.33 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  52.11 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.84 
 
 		 508 aa  315  9e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  46.6 
 
 		 505 aa  312  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.74 
 
 		 440 aa  312  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.59 
 
 		 472 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  48.61 
 
 		 493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.47 
 
 		 532 aa  300  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  44.55 
 
 		 517 aa  297  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  45.84 
 
 		 551 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.06 
 
 		 539 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  49.4 
 
 		 480 aa  290  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  46.61 
 
 		 527 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  47.88 
 
 		 509 aa  282  9e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  46.11 
 
 		 502 aa  282  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  47.83 
 
 		 517 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  47.45 
 
 		 486 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  45.66 
 
 		 543 aa  260  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  32.91 
 
 		 452 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  35.98 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  32.49 
 
 		 453 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.54 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  34.81 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.81 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  34.45 
 
 		 457 aa  209  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.67 
 
 		 446 aa  196  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  31.87 
 
 		 448 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.12 
 
 		 449 aa  194  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  28.51 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  32.91 
 
 		 448 aa  192  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  29.02 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  28.31 
 
 		 456 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  33.47 
 
 		 446 aa  189  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  33.41 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  33.8 
 
 		 451 aa  186  9e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  28.31 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  30.19 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  32.98 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  30.19 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  32.42 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  28.45 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  38.62 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  31.85 
 
 		 440 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  38.38 
 
 		 451 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  32.91 
 
 		 432 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  30.75 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  28.93 
 
 		 444 aa  170  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  39.46 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  36.79 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  28.33 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  26.72 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  27.59 
 
 		 451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  27.59 
 
 		 451 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  28.54 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  37.68 
 
 		 455 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  25.05 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  28.19 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  28.4 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  28.48 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  28.4 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  28.4 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  28.4 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  25.55 
 
 		 437 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  29.49 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  28.48 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  25.37 
 
 		 442 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  28.22 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  37.86 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  28.28 
 
 		 444 aa  160  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  31.12 
 
 		 444 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  34.05 
 
 		 450 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.41 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  33.19 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  25.79 
 
 		 442 aa  158  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  28.73 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  25.55 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  33.2 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.25 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  24.89 
 
 		 438 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  24.89 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  27.78 
 
 		 425 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  29.17 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>