More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1672 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  81.82 
 
 		 527 aa  827    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 539 aa  1062    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  58.23 
 
 		 543 aa  495  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  52.66 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  53.36 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  47.74 
 
 		 517 aa  409  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  53.45 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  54.56 
 
 		 509 aa  405  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  49.8 
 
 		 551 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  54.97 
 
 		 480 aa  392  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  48.69 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  50.4 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  47.92 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  49.47 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  49.19 
 
 		 515 aa  360  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  49.51 
 
 		 493 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  49.48 
 
 		 502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.9 
 
 		 472 aa  349  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.11 
 
 		 465 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  48.43 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  48.77 
 
 		 478 aa  337  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.96 
 
 		 449 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.1 
 
 		 455 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.31 
 
 		 455 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  47.31 
 
 		 455 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.97 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  46.39 
 
 		 494 aa  321  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  46.33 
 
 		 457 aa  316  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.73 
 
 		 509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  46.19 
 
 		 460 aa  305  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.7 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.37 
 
 		 508 aa  303  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  49.47 
 
 		 460 aa  299  9e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.95 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  43.24 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  29.25 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  34.02 
 
 		 453 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  27.78 
 
 		 455 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  29.34 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  31.6 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  33.12 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  31.89 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  34.43 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  33.4 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  32.78 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  30.71 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  28.63 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  32.38 
 
 		 432 aa  176  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  34.92 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.67 
 
 		 532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.62 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  31.48 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.22 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  29.88 
 
 		 443 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  28.09 
 
 		 446 aa  170  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  28.54 
 
 		 447 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  28.81 
 
 		 440 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  30.93 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  32.45 
 
 		 501 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  28.54 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1711  NusB/RsmB/TIM44  31.4 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  29.47 
 
 		 445 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  27.77 
 
 		 456 aa  154  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  24.64 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  24.44 
 
 		 442 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  30.96 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  27.48 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  29.84 
 
 		 468 aa  151  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  35.68 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  26.4 
 
 		 444 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.07 
 
 		 429 aa  150  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  29.82 
 
 		 448 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  30.22 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  27.2 
 
 		 448 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  28.31 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  25.26 
 
 		 435 aa  148  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  28.85 
 
 		 427 aa  148  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  27.52 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  26.86 
 
 		 448 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  28.69 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09910  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  29.64 
 
 		 531 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000618646 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.08 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  27.35 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  29.93 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  28.36 
 
 		 427 aa  145  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  25.47 
 
 		 444 aa  145  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  25.47 
 
 		 444 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  27.98 
 
 		 451 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  28.41 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  27.4 
 
 		 428 aa  143  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  26.74 
 
 		 444 aa  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  27.78 
 
 		 451 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  28.31 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  25.9 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.56 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  27.41 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  27.41 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  27.41 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  27.41 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  28.06 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>