More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5223 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 478 aa  929    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  69.79 
 
 		 484 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  64.44 
 
 		 452 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  62.53 
 
 		 455 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  64.71 
 
 		 449 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  62.53 
 
 		 455 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  62.23 
 
 		 462 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  62.31 
 
 		 455 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  62.75 
 
 		 457 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  65.01 
 
 		 460 aa  481  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  61.57 
 
 		 494 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  59.82 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.98 
 
 		 509 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  56.41 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  54.49 
 
 		 476 aa  415  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.47 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  54.47 
 
 		 489 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  53.99 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  52.59 
 
 		 505 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.88 
 
 		 472 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.07 
 
 		 532 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  52.25 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  53.31 
 
 		 493 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  55.35 
 
 		 517 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  51.55 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.71 
 
 		 495 aa  364  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  52.67 
 
 		 486 aa  363  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.69 
 
 		 539 aa  363  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  49.9 
 
 		 527 aa  362  8e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  53.83 
 
 		 480 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  56.6 
 
 		 460 aa  360  5e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  55.79 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  53.53 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  50.1 
 
 		 543 aa  333  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.81 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  47.51 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  36.36 
 
 		 446 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  33.12 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  33.84 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  36.12 
 
 		 448 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  34.13 
 
 		 452 aa  199  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  34.78 
 
 		 452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  29.26 
 
 		 449 aa  196  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  32.53 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  36.47 
 
 		 451 aa  193  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  30.85 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  36.17 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.77 
 
 		 449 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  33.48 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  39.15 
 
 		 439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  33.26 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.77 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  31.9 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.27 
 
 		 455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  36.17 
 
 		 501 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  31.57 
 
 		 443 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  40.26 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  39.83 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  40.26 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  30.62 
 
 		 462 aa  170  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  26.48 
 
 		 435 aa  169  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.47 
 
 		 444 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  29.85 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  32.34 
 
 		 432 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  28.38 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  30.75 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  27.25 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  29.28 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  31.39 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  27.13 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.93 
 
 		 449 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  33.55 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  27.63 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  29.85 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  29.37 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  29.5 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  29.5 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  36.19 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  29.5 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  29.72 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  29.5 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  31.76 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  29.28 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  29.31 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  28.73 
 
 		 444 aa  156  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  27.97 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  32.06 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  34.06 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  34.29 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  27.05 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  34.81 
 
 		 436 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  27.05 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00150  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.13 
 
 		 443 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0082  sun protein  34.81 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  27.89 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  31.19 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0082  sun protein  34.57 
 
 		 436 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531544  hitchhiker  0.0000000000001805 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  30.71 
 
 		 449 aa  149  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.38 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0085  sun protein  34.32 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>