More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  100 
 
 		 502 aa  972    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  52.16 
 
 		 517 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  51.48 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  50.4 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  54.86 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.03 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  53.31 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  52.22 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  50.41 
 
 		 471 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  50.4 
 
 		 551 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  48.84 
 
 		 452 aa  353  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  48.19 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  54.04 
 
 		 480 aa  349  6e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  48.94 
 
 		 489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  49.62 
 
 		 543 aa  335  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  48.47 
 
 		 515 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.67 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  45.05 
 
 		 484 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  47.45 
 
 		 493 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.4 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.21 
 
 		 449 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.92 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.4 
 
 		 472 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  47.01 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  47.1 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.4 
 
 		 509 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.97 
 
 		 495 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  47.38 
 
 		 478 aa  295  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  46.17 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.44 
 
 		 455 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  46.44 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.44 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.48 
 
 		 508 aa  277  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  47.76 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  44.29 
 
 		 491 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.83 
 
 		 453 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.13 
 
 		 455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  33.75 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.61 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  32.58 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  30.56 
 
 		 452 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  48 
 
 		 532 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  33.33 
 
 		 446 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  27.2 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  26.89 
 
 		 442 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  32.7 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  26.7 
 
 		 442 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  30.58 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  29.87 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  29.96 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  26.51 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  26.27 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  29.75 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  29.63 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  32.52 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  29.45 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  31.87 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  28.87 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  27.53 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  34.39 
 
 		 501 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  29.71 
 
 		 449 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  31.41 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  29.4 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  26.21 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  25.93 
 
 		 440 aa  148  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  33.19 
 
 		 451 aa  148  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  30.17 
 
 		 451 aa  148  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  27.71 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  27.1 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  28.9 
 
 		 448 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  30.43 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  26.15 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  26.58 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  26.2 
 
 		 424 aa  144  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  23.48 
 
 		 435 aa  143  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  28.44 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  28.99 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  26.24 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  26.71 
 
 		 425 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  29.48 
 
 		 432 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1711  NusB/RsmB/TIM44  31.63 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  26.89 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  26.24 
 
 		 444 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  26.94 
 
 		 444 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  26.67 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  26.67 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  26.67 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  26.67 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  25.47 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  31.29 
 
 		 464 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  27.25 
 
 		 427 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  25.64 
 
 		 438 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  27.88 
 
 		 429 aa  136  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  26.58 
 
 		 443 aa  136  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  26.77 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  28.11 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  27.23 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  25.17 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  28.34 
 
 		 429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  27.88 
 
 		 429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>