More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1647 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 263 aa  494  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  55.28 
 
 		 252 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  57.26 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  54.51 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  52.32 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  52.51 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  51.96 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  54.24 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  46.58 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  48.37 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  54.59 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  49.17 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  53.81 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  47.66 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  46.47 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25080  methyltransferase family protein  47.39 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.779034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  36.7 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  35.91 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  35.91 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  32.5 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  33.2 
 
 		 261 aa  99  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.2 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  33.2 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  33.2 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  33.2 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  33.2 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  33.2 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  33.2 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  31.95 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  32.2 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  35 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  32.2 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  32.2 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  32.2 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  31.09 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  31.09 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  31.09 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  28.93 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  31.12 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  28.99 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  31.78 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  32.37 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  32.73 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  37.08 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 249 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  36.52 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  24.79 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  27.57 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  34.47 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  28.27 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  27.31 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  24.37 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  33.15 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  25.7 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  33.47 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  28.34 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  29.92 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  24.37 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  33.33 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  30.58 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  32.89 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  38.67 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  26.69 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0087  SAM-dependent methyltransferase  24.46 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  27.82 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.73 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  33.33 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  26.67 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.91 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0179  hypothetical protein  25.45 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.26 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.94 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  33.9 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  44.76 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.65 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.91 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.22 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.01 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.75 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.18 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>