More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1348 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  100 
 
 		 434 aa  877    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  71.56 
 
 		 437 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  70.15 
 
 		 444 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  69.7 
 
 		 433 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  67.16 
 
 		 407 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  47.7 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  43.2 
 
 		 440 aa  348  8e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  44.76 
 
 		 430 aa  330  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  43.2 
 
 		 455 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  40.84 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  41.9 
 
 		 438 aa  312  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  44.04 
 
 		 433 aa  312  6.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  41.49 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  39.9 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  41.18 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  39.2 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  37.91 
 
 		 470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  40.55 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  38.53 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  37.5 
 
 		 426 aa  275  8e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  39.25 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  41.94 
 
 		 405 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  41.46 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  39.15 
 
 		 430 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  37.27 
 
 		 441 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  38.5 
 
 		 444 aa  252  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  36.41 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  37.37 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  36.27 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  36.54 
 
 		 419 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  34.57 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  34.17 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  36.66 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  36.66 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  36.66 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  34.67 
 
 		 402 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  34.92 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  34.92 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  34.92 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  36.29 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  37.3 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  35.41 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  35.14 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  34.58 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  33.81 
 
 		 429 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  34.29 
 
 		 428 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  34.65 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  32.92 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  33 
 
 		 407 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  33.79 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  33.61 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.52 
 
 		 400 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  31.1 
 
 		 421 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  32.22 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  36.64 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.5 
 
 		 418 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  33.57 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  31.98 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  34.68 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.42 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  32.78 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  32.78 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  33.97 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  30.58 
 
 		 445 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  31.82 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  34.12 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  32.64 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  31.71 
 
 		 391 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  33.42 
 
 		 415 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  32.3 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  34.26 
 
 		 414 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  32.8 
 
 		 432 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  31.83 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  33.15 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  29.58 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  32.78 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.07 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  33.24 
 
 		 480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  33.7 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  32.22 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  31.03 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  31.26 
 
 		 423 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  30.83 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  31.55 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.99 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  29.28 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  33.71 
 
 		 403 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  32.25 
 
 		 415 aa  161  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  31.83 
 
 		 408 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  30.46 
 
 		 405 aa  160  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  30.92 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  30.67 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.87 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  33.01 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  32.54 
 
 		 422 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  33.01 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  29.72 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  33.01 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  29.06 
 
 		 391 aa  156  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>